Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SFMBT2Q5VUG0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SFMBT2Q5VUG0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SFMBT2Q5VUG0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SFMBT2Q5VUG0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SFMBT2Q5VUG0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SFMBT2Q5VUG0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SFMBT2Q5VUG0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SFMBT2Q5VUG0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SFMBT2Q5VUG0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SFMBT2Q5VUG0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SFMBT2Q5VUG0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SFMBT2Q5VUG0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SFMBT2Q5VUG0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SFMBT2Q5VUG0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SFMBT2Q5VUG0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SFMBT2Q5VUG0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SFMBT2Q5VUG0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SFMBT2Q5VUG0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SFMBT2Q5VUG0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SFMBT2Q5VUG0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SFMBT2Q5VUG0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SFMBT2Q5VUG0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SFMBT2Q5VUG0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SFMBT2Q5VUG0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SFMBT2Q5VUG0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SFMBT2Q5VUG0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SFMBT2Q5VUG0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SFMBT2Q5VUG0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SFMBT2Q5VUG0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SFMBT2Q5VUG0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SFMBT2Q5VUG0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SFMBT2Q5VUG0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SFMBT2Q5VUG0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SFMBT2Q5VUG0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SFMBT2Q5VUG0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SFMBT2Q5VUG0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SFMBT2Q5VUG0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SFMBT2Q5VUG0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SFMBT2Q5VUG0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SFMBT2Q5VUG0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SFMBT2Q5VUG0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SFMBT2Q5VUG0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SFMBT2Q5VUG0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SFMBT2Q5VUG0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SFMBT2Q5VUG0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SFMBT2Q5VUG0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SFMBT2Q5VUG0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SFMBT2Q5VUG0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SFMBT2Q5VUG0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SFMBT2Q5VUG0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SFMBT2Q5VUG0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SFMBT2Q5VUG0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SFMBT2Q5VUG0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SFMBT2Q5VUG0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SFMBT2Q5VUG0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SFMBT2Q5VUG0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SFMBT2Q5VUG0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SFMBT2Q5VUG0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SFMBT2Q5VUG0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SFMBT2Q5VUG0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SFMBT2Q5VUG0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SFMBT2Q5VUG0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SFMBT2Q5VUG0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SFMBT2Q5VUG0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SFMBT2Q5VUG0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SFMBT2Q5VUG0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SFMBT2Q5VUG0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SFMBT2Q5VUG0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SFMBT2Q5VUG0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SFMBT2Q5VUG0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SFMBT2Q5VUG0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SFMBT2Q5VUG0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SFMBT2Q5VUG0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SFMBT2Q5VUG0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SFMBT2Q5VUG0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SFMBT2Q5VUG0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SFMBT2Q5VUG0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SFMBT2Q5VUG0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SFMBT2Q5VUG0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SFMBT2Q5VUG0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SFMBT2Q5VUG0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SFMBT2Q5VUG0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SFMBT2Q5VUG0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SFMBT2Q5VUG0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SFMBT2Q5VUG0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SFMBT2Q5VUG0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SFMBT2Q5VUG0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SFMBT2Q5VUG0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SFMBT2Q5VUG0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SFMBT2Q5VUG0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SFMBT2Q5VUG0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SFMBT2Q5VUG0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SFMBT2Q5VUG0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SFMBT2Q5VUG0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SFMBT2Q5VUG0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SFMBT2Q5VUG0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SFMBT2Q5VUG0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SFMBT2Q5VUG0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SFMBT2Q5VUG0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms