Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM78Q5T7P6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM78Q5T7P6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM78Q5T7P6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM78Q5T7P6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM78Q5T7P6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM78Q5T7P6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM78Q5T7P6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM78Q5T7P6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM78Q5T7P6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM78Q5T7P6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM78Q5T7P6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM78Q5T7P6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM78Q5T7P6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM78Q5T7P6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM78Q5T7P6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM78Q5T7P6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM78Q5T7P6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM78Q5T7P6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM78Q5T7P6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM78Q5T7P6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM78Q5T7P6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM78Q5T7P6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM78Q5T7P6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM78Q5T7P6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM78Q5T7P6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM78Q5T7P6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM78Q5T7P6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM78Q5T7P6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM78Q5T7P6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMEM78Q5T7P6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMEM78Q5T7P6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM78Q5T7P6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM78Q5T7P6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM78Q5T7P6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM78Q5T7P6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM78Q5T7P6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM78Q5T7P6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM78Q5T7P6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM78Q5T7P6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM78Q5T7P6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM78Q5T7P6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM78Q5T7P6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM78Q5T7P6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM78Q5T7P6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM78Q5T7P6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM78Q5T7P6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM78Q5T7P6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM78Q5T7P6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM78Q5T7P6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM78Q5T7P6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM78Q5T7P6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM78Q5T7P6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM78Q5T7P6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM78Q5T7P6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM78Q5T7P6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM78Q5T7P6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM78Q5T7P6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM78Q5T7P6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM78Q5T7P6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM78Q5T7P6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM78Q5T7P6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM78Q5T7P6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM78Q5T7P6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM78Q5T7P6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM78Q5T7P6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM78Q5T7P6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM78Q5T7P6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM78Q5T7P6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM78Q5T7P6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM78Q5T7P6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM78Q5T7P6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM78Q5T7P6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM78Q5T7P6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM78Q5T7P6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM78Q5T7P6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM78Q5T7P6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM78Q5T7P6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM78Q5T7P6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM78Q5T7P6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM78Q5T7P6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM78Q5T7P6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM78Q5T7P6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM78Q5T7P6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM78Q5T7P6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM78Q5T7P6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM78Q5T7P6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM78Q5T7P6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM78Q5T7P6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM78Q5T7P6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM78Q5T7P6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM78Q5T7P6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM78Q5T7P6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM78Q5T7P6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM78Q5T7P6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM78Q5T7P6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM78Q5T7P6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM78Q5T7P6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM78Q5T7P6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM78Q5T7P6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms