Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TDRD12Q587J7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TDRD12Q587J7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TDRD12Q587J7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TDRD12Q587J7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TDRD12Q587J7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TDRD12Q587J7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TDRD12Q587J7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TDRD12Q587J7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TDRD12Q587J7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TDRD12Q587J7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
TDRD12Q587J7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TDRD12Q587J7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TDRD12Q587J7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TDRD12Q587J7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TDRD12Q587J7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TDRD12Q587J7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TDRD12Q587J7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TDRD12Q587J7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TDRD12Q587J7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TDRD12Q587J7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TDRD12Q587J7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TDRD12Q587J7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TDRD12Q587J7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TDRD12Q587J7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TDRD12Q587J7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TDRD12Q587J7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TDRD12Q587J7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TDRD12Q587J7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TDRD12Q587J7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TDRD12Q587J7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TDRD12Q587J7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TDRD12Q587J7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TDRD12Q587J7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TDRD12Q587J7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TDRD12Q587J7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TDRD12Q587J7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TDRD12Q587J7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TDRD12Q587J7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TDRD12Q587J7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TDRD12Q587J7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TDRD12Q587J7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TDRD12Q587J7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TDRD12Q587J7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TDRD12Q587J7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TDRD12Q587J7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TDRD12Q587J7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TDRD12Q587J7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TDRD12Q587J7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TDRD12Q587J7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TDRD12Q587J7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TDRD12Q587J7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TDRD12Q587J7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TDRD12Q587J7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TDRD12Q587J7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TDRD12Q587J7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TDRD12Q587J7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TDRD12Q587J7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TDRD12Q587J7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TDRD12Q587J7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TDRD12Q587J7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TDRD12Q587J7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TDRD12Q587J7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TDRD12Q587J7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TDRD12Q587J7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TDRD12Q587J7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TDRD12Q587J7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TDRD12Q587J7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TDRD12Q587J7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TDRD12Q587J7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TDRD12Q587J7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TDRD12Q587J7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TDRD12Q587J7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TDRD12Q587J7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TDRD12Q587J7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TDRD12Q587J7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TDRD12Q587J7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TDRD12Q587J7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TDRD12Q587J7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TDRD12Q587J7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
TDRD12Q587J7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TDRD12Q587J7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TDRD12Q587J7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TDRD12Q587J7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TDRD12Q587J7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TDRD12Q587J7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TDRD12Q587J7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TDRD12Q587J7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TDRD12Q587J7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TDRD12Q587J7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TDRD12Q587J7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TDRD12Q587J7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TDRD12Q587J7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TDRD12Q587J7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TDRD12Q587J7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TDRD12Q587J7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TDRD12Q587J7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TDRD12Q587J7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TDRD12Q587J7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TDRD12Q587J7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms