Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NRF1Q16656 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NRF1Q16656 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NRF1Q16656 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NRF1Q16656 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NRF1Q16656 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NRF1Q16656 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NRF1Q16656 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NRF1Q16656 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NRF1Q16656 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NRF1Q16656 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRF1Q16656 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRF1Q16656 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRF1Q16656 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRF1Q16656 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRF1Q16656 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRF1Q16656 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRF1Q16656 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRF1Q16656 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRF1Q16656 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NRF1Q16656 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NRF1Q16656 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NRF1Q16656 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NRF1Q16656 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NRF1Q16656 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NRF1Q16656 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NRF1Q16656 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NRF1Q16656 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NRF1Q16656 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NRF1Q16656 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRF1Q16656 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRF1Q16656 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRF1Q16656 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRF1Q16656 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRF1Q16656 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRF1Q16656 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRF1Q16656 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRF1Q16656 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRF1Q16656 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NRF1Q16656 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NRF1Q16656 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NRF1Q16656 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NRF1Q16656 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRF1Q16656 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRF1Q16656 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRF1Q16656 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRF1Q16656 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRF1Q16656 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRF1Q16656 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NRF1Q16656 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NRF1Q16656 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NRF1Q16656 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NRF1Q16656 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NRF1Q16656 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NRF1Q16656 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NRF1Q16656 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NRF1Q16656 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NRF1Q16656 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NRF1Q16656 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NRF1Q16656 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NRF1Q16656 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NRF1Q16656 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRF1Q16656 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRF1Q16656 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
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NRF1Q16656 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRF1Q16656 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRF1Q16656 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRF1Q16656 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRF1Q16656 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRF1Q16656 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRF1Q16656 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
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NRF1Q16656 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRF1Q16656 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRF1Q16656 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NRF1Q16656 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRF1Q16656 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRF1Q16656 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRF1Q16656 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NRF1Q16656 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRF1Q16656 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRF1Q16656 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRF1Q16656 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRF1Q16656 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRF1Q16656 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRF1Q16656 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NRF1Q16656 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NRF1Q16656 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NRF1Q16656 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NRF1Q16656 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NRF1Q16656 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NRF1Q16656 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NRF1Q16656 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NRF1Q16656 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NRF1Q16656 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NRF1Q16656 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRF1Q16656 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRF1Q16656 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRF1Q16656 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
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