Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC1Q15751 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC1Q15751 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC1Q15751 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC1Q15751 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC1Q15751 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC1Q15751 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC1Q15751 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC1Q15751 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC1Q15751 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC1Q15751 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC1Q15751 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC1Q15751 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC1Q15751 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERC1Q15751 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC1Q15751 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC1Q15751 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC1Q15751 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC1Q15751 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC1Q15751 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC1Q15751 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC1Q15751 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC1Q15751 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC1Q15751 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC1Q15751 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC1Q15751 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC1Q15751 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC1Q15751 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC1Q15751 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC1Q15751 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC1Q15751 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC1Q15751 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC1Q15751 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC1Q15751 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC1Q15751 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC1Q15751 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC1Q15751 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC1Q15751 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC1Q15751 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC1Q15751 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC1Q15751 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERC1Q15751 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERC1Q15751 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERC1Q15751 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERC1Q15751 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC1Q15751 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC1Q15751 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC1Q15751 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC1Q15751 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC1Q15751 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC1Q15751 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC1Q15751 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HERC1Q15751 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERC1Q15751 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERC1Q15751 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERC1Q15751 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERC1Q15751 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC1Q15751 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC1Q15751 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC1Q15751 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC1Q15751 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC1Q15751 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC1Q15751 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC1Q15751 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC1Q15751 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC1Q15751 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC1Q15751 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC1Q15751 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC1Q15751 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC1Q15751 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC1Q15751 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC1Q15751 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC1Q15751 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC1Q15751 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC1Q15751 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC1Q15751 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC1Q15751 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC1Q15751 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC1Q15751 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC1Q15751 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC1Q15751 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC1Q15751 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC1Q15751 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC1Q15751 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC1Q15751 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC1Q15751 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC1Q15751 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC1Q15751 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC1Q15751 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC1Q15751 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC1Q15751 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HERC1Q15751 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERC1Q15751 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HERC1Q15751 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HERC1Q15751 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERC1Q15751 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HERC1Q15751 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERC1Q15751 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERC1Q15751 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERC1Q15751 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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