Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EIF4EBP1Q13541 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EIF4EBP1Q13541 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EIF4EBP1Q13541 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EIF4EBP1Q13541 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EIF4EBP1Q13541 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EIF4EBP1Q13541 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EIF4EBP1Q13541 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EIF4EBP1Q13541 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EIF4EBP1Q13541 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EIF4EBP1Q13541 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EIF4EBP1Q13541 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EIF4EBP1Q13541 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EIF4EBP1Q13541 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EIF4EBP1Q13541 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EIF4EBP1Q13541 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
EIF4EBP1Q13541 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
EIF4EBP1Q13541 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EIF4EBP1Q13541 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
EIF4EBP1Q13541 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EIF4EBP1Q13541 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
EIF4EBP1Q13541 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EIF4EBP1Q13541 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EIF4EBP1Q13541 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EIF4EBP1Q13541 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EIF4EBP1Q13541 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EIF4EBP1Q13541 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EIF4EBP1Q13541 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EIF4EBP1Q13541 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
EIF4EBP1Q13541 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EIF4EBP1Q13541 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EIF4EBP1Q13541 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EIF4EBP1Q13541 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EIF4EBP1Q13541 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
EIF4EBP1Q13541 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EIF4EBP1Q13541 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EIF4EBP1Q13541 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EIF4EBP1Q13541 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EIF4EBP1Q13541 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EIF4EBP1Q13541 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EIF4EBP1Q13541 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EIF4EBP1Q13541 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EIF4EBP1Q13541 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EIF4EBP1Q13541 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EIF4EBP1Q13541 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EIF4EBP1Q13541 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
EIF4EBP1Q13541 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EIF4EBP1Q13541 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EIF4EBP1Q13541 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EIF4EBP1Q13541 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EIF4EBP1Q13541 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EIF4EBP1Q13541 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EIF4EBP1Q13541 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EIF4EBP1Q13541 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EIF4EBP1Q13541 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EIF4EBP1Q13541 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EIF4EBP1Q13541 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EIF4EBP1Q13541 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EIF4EBP1Q13541 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EIF4EBP1Q13541 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EIF4EBP1Q13541 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EIF4EBP1Q13541 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EIF4EBP1Q13541 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EIF4EBP1Q13541 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EIF4EBP1Q13541 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EIF4EBP1Q13541 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EIF4EBP1Q13541 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EIF4EBP1Q13541 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EIF4EBP1Q13541 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EIF4EBP1Q13541 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EIF4EBP1Q13541 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EIF4EBP1Q13541 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EIF4EBP1Q13541 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EIF4EBP1Q13541 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EIF4EBP1Q13541 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EIF4EBP1Q13541 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EIF4EBP1Q13541 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EIF4EBP1Q13541 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EIF4EBP1Q13541 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EIF4EBP1Q13541 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EIF4EBP1Q13541 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EIF4EBP1Q13541 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EIF4EBP1Q13541 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EIF4EBP1Q13541 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EIF4EBP1Q13541 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EIF4EBP1Q13541 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EIF4EBP1Q13541 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EIF4EBP1Q13541 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EIF4EBP1Q13541 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EIF4EBP1Q13541 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EIF4EBP1Q13541 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
EIF4EBP1Q13541 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EIF4EBP1Q13541 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EIF4EBP1Q13541 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EIF4EBP1Q13541 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EIF4EBP1Q13541 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EIF4EBP1Q13541 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EIF4EBP1Q13541 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EIF4EBP1Q13541 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EIF4EBP1Q13541 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms