Protein–RNA interactions for Protein: Q12217

TY1A-BR, Transposon Ty1-BR Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BRQ12217 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt8.72□□□□□ -1.01
TY1A-BRQ12217 IMT4tM(CAU)E 72 nt8.72□□□□□ -1.01
TY1A-BRQ12217 IMT3tM(CAU)J3 72 nt8.72□□□□□ -1.01
TY1A-BRQ12217 IMT1tM(CAU)O1 72 nt8.72□□□□□ -1.01
TY1A-BRQ12217 IMT2tM(CAU)P 72 nt8.72□□□□□ -1.01
TY1A-BRQ12217 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt8.72□□□□□ -1.01
TY1A-BRQ12217 MRPL49YJL096W 486 nt8.72□□□□□ -1.01
TY1A-BRQ12217 MRP7YNL005C 1116 nt8.72□□□□□ -1.01
TY1A-BRQ12217 YDR336WYDR336W 945 nt8.71□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 DIC1YLR348C 897 nt8.71□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 YML090WYML090W 387 nt8.71□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 MTQ1YNL063W 945 nt8.71□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 HRT1YOL133W 366 nt8.71□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 TFB6YOR352W 1032 nt8.71□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 CLD1YGR110W 1338 nt8.71□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 GDH3YAL062W 1374 nt8.71□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 SAY1YGR263C 1275 nt8.7□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 YOL106WYOL106W 354 nt8.7□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 YOL162WYOL162W 648 nt8.7□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 IFA38YBR159W 1044 nt8.7□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 HOL1YNR055C 1761 nt8.7□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 ORM1YGR038W 669 nt8.69□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 VMA6YLR447C 1038 nt8.69□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 YOR062CYOR062C 807 nt8.69□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 STE4YOR212W 1272 nt8.69□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 ALG5YPL227C 1005 nt8.69□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 PRP9YDL030W 1593 nt8.69□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 CBK1YNL161W 2271 nt8.68□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 MCM5YLR274W 2328 nt8.68□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 LSM6YDR378C 261 nt8.68□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 YEA6YEL006W 1008 nt8.68□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 HPM1YIL110W 1134 nt8.68□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 YKR051WYKR051W 1257 nt8.68□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 ADE1YAR015W 921 nt8.68□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 ERV25YML012W 636 nt8.68□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 LOA1YPR139C 903 nt8.68□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 YFL052WYFL052W 1398 nt8.68□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 YPL245WYPL245W 1365 nt8.68□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 POP6YGR030C 477 nt8.67□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt8.67□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 POC4YPL144W 447 nt8.67□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 BSP1YPR171W 1731 nt8.66□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 MLS1YNL117W 1665 nt8.66□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 FEN2YCR028C 1539 nt8.66□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 SSU1YPL092W 1377 nt8.66□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 YPR084WYPR084W 1371 nt8.66□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 ERG24YNL280C 1317 nt8.66□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 YFL012WYFL012W 447 nt8.66□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 HIF1YLL022C 1158 nt8.66□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 CMS1YLR003C 876 nt8.66□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 SMM1YNR015W 1155 nt8.66□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 HMG2YLR450W 3138 nt8.66□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 EST3YIL009C-A 546 nt8.65□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 YKL202WYKL202W 582 nt8.65□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 YLL047WYLL047W 384 nt8.65□□□□□ -1.02
TY1A-BRQ12217 MET2YNL277W 1461 nt8.64□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt8.64□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 URA5YML106W 681 nt8.64□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 FYV6YNL133C 522 nt8.64□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 YDC1YPL087W 954 nt8.64□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 ACO2YJL200C 2370 nt8.63□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 KSS1YGR040W 1107 nt8.63□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 CDC8YJR057W 651 nt8.63□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt8.63□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 YGP1YNL160W 1065 nt8.63□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 IES2YNL215W 963 nt8.63□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 YPR153WYPR153W 423 nt8.63□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 CIT2YCR005C 1383 nt8.62□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 REV7YIL139C 738 nt8.62□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 YIR016WYIR016W 798 nt8.62□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 SCP1YOR367W 603 nt8.62□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 CHL4YDR254W 1377 nt8.61□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 YFT2YDR319C 825 nt8.61□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt8.61□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 PHM8YER037W 966 nt8.61□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 NMA2YGR010W 1188 nt8.61□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 OPI1YHL020C 1215 nt8.61□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 RPI1YIL119C 1224 nt8.61□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 AQY2YLL052C 450 nt8.61□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 YLR365WYLR365W 333 nt8.61□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 GPM3YOL056W 912 nt8.61□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 HFI1YPL254W 1467 nt8.61□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 SPO77YLR341W 1434 nt8.61□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 NPP1YCR026C 2229 nt8.61□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 MST1YKL194C 1389 nt8.61□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 CLB4YLR210W 1383 nt8.61□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 ARO10YDR380W 1908 nt8.6□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 APM4YOL062C 1476 nt8.6□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 SPC25YER018C 666 nt8.6□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 SNF4YGL115W 969 nt8.6□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 YGR291CYGR291C 222 nt8.6□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 CPR7YJR032W 1182 nt8.6□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 YNL174WYNL174W 573 nt8.6□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 YBR013CYBR013C 390 nt8.6□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 FSF1YOR271C 984 nt8.6□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 JID1YPR061C 906 nt8.6□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt8.6□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 APM3YBR288C 1452 nt8.59□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 RTN2YDL204W 1182 nt8.59□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 BUD26YDR241W 288 nt8.59□□□□□ -1.03
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