Protein–RNA interactions for Protein: Q03957

CTK1, CTD kinase subunit alpha, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTK1Q03957 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.56□□□□□ -1.2
CTK1Q03957 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.56□□□□□ -1.2
CTK1Q03957 PUP3YER094C 618 nt7.55□□□□□ -1.2
CTK1Q03957 YIL168WYIL168W 384 nt7.54□□□□□ -1.2
CTK1Q03957 TDH1YJL052W 999 nt7.54□□□□□ -1.2
CTK1Q03957 TOS1YBR162C 1368 nt7.54□□□□□ -1.2
CTK1Q03957 EDC2YER035W 438 nt7.53□□□□□ -1.2
CTK1Q03957 LRO1YNR008W 1986 nt7.53□□□□□ -1.2
CTK1Q03957 BUR6YER159C 429 nt7.52□□□□□ -1.21
CTK1Q03957 YLR072WYLR072W 2082 nt7.51□□□□□ -1.21
CTK1Q03957 EHT1YBR177C 1356 nt7.51□□□□□ -1.21
CTK1Q03957 ADE16YLR028C 1776 nt7.51□□□□□ -1.21
CTK1Q03957 JHD1YER051W 1479 nt7.5□□□□□ -1.21
CTK1Q03957 HXT8YJL214W 1710 nt7.5□□□□□ -1.21
CTK1Q03957 UFD1YGR048W 1086 nt7.5□□□□□ -1.21
CTK1Q03957 NUP53YMR153W 1428 nt7.5□□□□□ -1.21
CTK1Q03957 FIT1YDR534C 1587 nt7.5□□□□□ -1.21
CTK1Q03957 YJL043WYJL043W 774 nt7.49□□□□□ -1.21
CTK1Q03957 YNL165WYNL165W 1221 nt7.49□□□□□ -1.21
CTK1Q03957 TIM50YPL063W 1431 nt7.49□□□□□ -1.21
CTK1Q03957 DUS3YLR401C 2007 nt7.49□□□□□ -1.21
CTK1Q03957 YOR268CYOR268C 399 nt7.48□□□□□ -1.21
CTK1Q03957 DIA4YHR011W 1341 nt7.48□□□□□ -1.21
CTK1Q03957 LEA1YPL213W 717 nt7.47□□□□□ -1.21
CTK1Q03957 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.46□□□□□ -1.22
CTK1Q03957 FUS3YBL016W 1062 nt7.46□□□□□ -1.22
CTK1Q03957 LPD1YFL018C 1500 nt7.46□□□□□ -1.22
CTK1Q03957 DIP5YPL265W 1827 nt7.45□□□□□ -1.22
CTK1Q03957 PRE10YOR362C 867 nt7.45□□□□□ -1.22
CTK1Q03957 IDP3YNL009W 1263 nt7.44□□□□□ -1.22
CTK1Q03957 ABP1YCR088W 1779 nt7.43□□□□□ -1.22
CTK1Q03957 PET494YNR045W 1470 nt7.43□□□□□ -1.22
CTK1Q03957 PMU1YKL128C 888 nt7.43□□□□□ -1.22
CTK1Q03957 RCF1YML030W 480 nt7.43□□□□□ -1.22
CTK1Q03957 SWP1YMR149W 861 nt7.43□□□□□ -1.22
CTK1Q03957 HAC1YFL031W 717 nt7.42□□□□□ -1.22
CTK1Q03957 PSP2YML017W 1782 nt7.41□□□□□ -1.22
CTK1Q03957 BUD31YCR063W 474 nt7.41□□□□□ -1.22
CTK1Q03957 RRT6YGL146C 936 nt7.41□□□□□ -1.22
CTK1Q03957 HIS3YOR202W 663 nt7.41□□□□□ -1.22
CTK1Q03957 ATG22YCL038C 1587 nt7.41□□□□□ -1.22
CTK1Q03957 INO1YJL153C 1602 nt7.41□□□□□ -1.22
CTK1Q03957 RMA1YKL132C 1293 nt7.4□□□□□ -1.22
CTK1Q03957 APT1YML022W 564 nt7.4□□□□□ -1.22
CTK1Q03957 MFG1YDL233W 1377 nt7.39□□□□□ -1.23
CTK1Q03957 PFS2YNL317W 1398 nt7.39□□□□□ -1.23
CTK1Q03957 SRN2YLR119W 642 nt7.39□□□□□ -1.23
CTK1Q03957 HMT1YBR034C 1047 nt7.39□□□□□ -1.23
CTK1Q03957 ALR1YOL130W 2580 nt7.39□□□□□ -1.23
CTK1Q03957 TOM71YHR117W 1920 nt7.38□□□□□ -1.23
CTK1Q03957 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.38□□□□□ -1.23
CTK1Q03957 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.38□□□□□ -1.23
CTK1Q03957 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.38□□□□□ -1.23
CTK1Q03957 ALG7YBR243C 1347 nt7.37□□□□□ -1.23
CTK1Q03957 ARO3YDR035W 1113 nt7.37□□□□□ -1.23
CTK1Q03957 BAP3YDR046C 1815 nt7.36□□□□□ -1.23
CTK1Q03957 HSV2YGR223C 1347 nt7.36□□□□□ -1.23
CTK1Q03957 NCA3YJL116C 1014 nt7.36□□□□□ -1.23
CTK1Q03957 MDH2YOL126C 1134 nt7.36□□□□□ -1.23
CTK1Q03957 NDE2YDL085W 1638 nt7.35□□□□□ -1.23
CTK1Q03957 PNS1YOR161C 1620 nt7.35□□□□□ -1.23
CTK1Q03957 SPR1YOR190W 1338 nt7.35□□□□□ -1.23
CTK1Q03957 NSG2YNL156C 900 nt7.35□□□□□ -1.23
CTK1Q03957 WSC4YHL028W 1818 nt7.35□□□□□ -1.23
CTK1Q03957 WSC3YOL105C 1671 nt7.35□□□□□ -1.23
CTK1Q03957 EEB1YPL095C 1371 nt7.34□□□□□ -1.23
CTK1Q03957 ARG7YMR062C 1326 nt7.34□□□□□ -1.23
CTK1Q03957 YDR476CYDR476C 675 nt7.34□□□□□ -1.23
CTK1Q03957 GLY1YEL046C 1164 nt7.34□□□□□ -1.23
CTK1Q03957 CPT1YNL130C 1182 nt7.34□□□□□ -1.23
CTK1Q03957 TDA4YJR116W 840 nt7.33□□□□□ -1.24
CTK1Q03957 YPL071CYPL071C 471 nt7.33□□□□□ -1.24
CTK1Q03957 MRN1YPL184C 1839 nt7.33□□□□□ -1.24
CTK1Q03957 TIF3YPR163C 1311 nt7.32□□□□□ -1.24
CTK1Q03957 MLS1YNL117W 1665 nt7.32□□□□□ -1.24
CTK1Q03957 YLR173WYLR173W 1827 nt7.32□□□□□ -1.24
CTK1Q03957 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt7.32□□□□□ -1.24
CTK1Q03957 TGL5YOR081C 2250 nt7.32□□□□□ -1.24
CTK1Q03957 SLM3YDL033C 1254 nt7.31□□□□□ -1.24
CTK1Q03957 YJL211CYJL211C 444 nt7.31□□□□□ -1.24
CTK1Q03957 PRE5YMR314W 705 nt7.31□□□□□ -1.24
CTK1Q03957 YNL140CYNL140C 570 nt7.31□□□□□ -1.24
CTK1Q03957 SNP1YIL061C 903 nt7.3□□□□□ -1.24
CTK1Q03957 MRP7YNL005C 1116 nt7.29□□□□□ -1.24
CTK1Q03957 DST1YGL043W 930 nt7.28□□□□□ -1.24
CTK1Q03957 YGR137WYGR137W 375 nt7.28□□□□□ -1.24
CTK1Q03957 INM1YHR046C 888 nt7.28□□□□□ -1.24
CTK1Q03957 YLR358CYLR358C 564 nt7.28□□□□□ -1.24
CTK1Q03957 MET30YIL046W 1923 nt7.28□□□□□ -1.24
CTK1Q03957 CPR2YHR057C 618 nt7.26□□□□□ -1.25
CTK1Q03957 BMT5YIL096C 1011 nt7.26□□□□□ -1.25
CTK1Q03957 YPL247CYPL247C 1572 nt7.25□□□□□ -1.25
CTK1Q03957 ELP6YMR312W 822 nt7.25□□□□□ -1.25
CTK1Q03957 PMT7YDR307W 1989 nt7.25□□□□□ -1.25
CTK1Q03957 CRN1YLR429W 1956 nt7.25□□□□□ -1.25
CTK1Q03957 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.24□□□□□ -1.25
CTK1Q03957 YNL190WYNL190W 615 nt7.24□□□□□ -1.25
CTK1Q03957 MNN9YPL050C 1188 nt7.24□□□□□ -1.25
CTK1Q03957 STE3YKL178C 1413 nt7.24□□□□□ -1.25
CTK1Q03957 MTC6YHR151C 1581 nt7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 60.7 ms