Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1BQ00975 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1BQ00975 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1BQ00975 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1BQ00975 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1BQ00975 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1BQ00975 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1BQ00975 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1BQ00975 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1BQ00975 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA1BQ00975 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA1BQ00975 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA1BQ00975 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1BQ00975 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1BQ00975 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1BQ00975 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1BQ00975 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1BQ00975 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1BQ00975 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1BQ00975 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1BQ00975 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1BQ00975 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1BQ00975 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1BQ00975 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1BQ00975 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1BQ00975 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA1BQ00975 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA1BQ00975 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA1BQ00975 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA1BQ00975 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA1BQ00975 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA1BQ00975 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA1BQ00975 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA1BQ00975 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA1BQ00975 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA1BQ00975 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA1BQ00975 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA1BQ00975 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA1BQ00975 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA1BQ00975 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA1BQ00975 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA1BQ00975 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA1BQ00975 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA1BQ00975 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1BQ00975 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1BQ00975 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1BQ00975 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1BQ00975 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1BQ00975 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1BQ00975 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1BQ00975 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1BQ00975 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1BQ00975 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1BQ00975 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1BQ00975 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1BQ00975 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1BQ00975 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA1BQ00975 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA1BQ00975 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA1BQ00975 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA1BQ00975 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA1BQ00975 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA1BQ00975 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA1BQ00975 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA1BQ00975 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CACNA1BQ00975 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1BQ00975 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1BQ00975 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1BQ00975 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1BQ00975 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1BQ00975 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1BQ00975 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1BQ00975 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA1BQ00975 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA1BQ00975 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA1BQ00975 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA1BQ00975 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA1BQ00975 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA1BQ00975 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1BQ00975 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1BQ00975 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1BQ00975 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1BQ00975 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1BQ00975 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA1BQ00975 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA1BQ00975 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA1BQ00975 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA1BQ00975 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA1BQ00975 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA1BQ00975 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA1BQ00975 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA1BQ00975 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA1BQ00975 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA1BQ00975 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA1BQ00975 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1BQ00975 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1BQ00975 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1BQ00975 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1BQ00975 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1BQ00975 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms