Protein–RNA interactions for Protein: P61578

ERVK-16, Endogenous retrovirus group K member 16 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-16P61578 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-16P61578 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-16P61578 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-16P61578 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-16P61578 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-16P61578 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-16P61578 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-16P61578 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-16P61578 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-16P61578 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-16P61578 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-16P61578 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-16P61578 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-16P61578 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-16P61578 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-16P61578 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-16P61578 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-16P61578 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-16P61578 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-16P61578 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK-16P61578 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK-16P61578 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK-16P61578 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK-16P61578 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-16P61578 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-16P61578 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-16P61578 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK-16P61578 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK-16P61578 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK-16P61578 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK-16P61578 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK-16P61578 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK-16P61578 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK-16P61578 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVK-16P61578 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVK-16P61578 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVK-16P61578 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK-16P61578 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK-16P61578 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK-16P61578 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK-16P61578 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK-16P61578 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK-16P61578 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK-16P61578 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK-16P61578 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK-16P61578 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK-16P61578 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK-16P61578 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK-16P61578 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK-16P61578 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK-16P61578 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK-16P61578 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK-16P61578 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK-16P61578 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK-16P61578 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-16P61578 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-16P61578 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-16P61578 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-16P61578 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-16P61578 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-16P61578 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-16P61578 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-16P61578 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-16P61578 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-16P61578 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-16P61578 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-16P61578 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-16P61578 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK-16P61578 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK-16P61578 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK-16P61578 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK-16P61578 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-16P61578 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-16P61578 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-16P61578 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-16P61578 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-16P61578 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-16P61578 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-16P61578 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-16P61578 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-16P61578 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-16P61578 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-16P61578 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-16P61578 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
ERVK-16P61578 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-16P61578 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-16P61578 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-16P61578 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-16P61578 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-16P61578 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-16P61578 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-16P61578 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-16P61578 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-16P61578 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-16P61578 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-16P61578 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-16P61578 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-16P61578 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-16P61578 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-16P61578 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms