Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MTCP1P56278 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTCP1P56278 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MTCP1P56278 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTCP1P56278 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTCP1P56278 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTCP1P56278 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTCP1P56278 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTCP1P56278 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTCP1P56278 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MTCP1P56278 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTCP1P56278 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTCP1P56278 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTCP1P56278 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTCP1P56278 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTCP1P56278 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTCP1P56278 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTCP1P56278 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MTCP1P56278 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTCP1P56278 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTCP1P56278 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTCP1P56278 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTCP1P56278 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTCP1P56278 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTCP1P56278 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTCP1P56278 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTCP1P56278 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTCP1P56278 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTCP1P56278 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTCP1P56278 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MTCP1P56278 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTCP1P56278 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTCP1P56278 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTCP1P56278 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTCP1P56278 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MTCP1P56278 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTCP1P56278 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTCP1P56278 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTCP1P56278 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTCP1P56278 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
MTCP1P56278 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTCP1P56278 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTCP1P56278 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTCP1P56278 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTCP1P56278 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTCP1P56278 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MTCP1P56278 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTCP1P56278 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTCP1P56278 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTCP1P56278 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTCP1P56278 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTCP1P56278 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTCP1P56278 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTCP1P56278 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTCP1P56278 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTCP1P56278 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTCP1P56278 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTCP1P56278 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTCP1P56278 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTCP1P56278 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTCP1P56278 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTCP1P56278 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTCP1P56278 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTCP1P56278 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MTCP1P56278 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MTCP1P56278 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MTCP1P56278 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTCP1P56278 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTCP1P56278 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTCP1P56278 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTCP1P56278 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTCP1P56278 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTCP1P56278 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTCP1P56278 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTCP1P56278 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTCP1P56278 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTCP1P56278 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MTCP1P56278 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTCP1P56278 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTCP1P56278 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTCP1P56278 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTCP1P56278 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTCP1P56278 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTCP1P56278 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTCP1P56278 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTCP1P56278 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTCP1P56278 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTCP1P56278 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTCP1P56278 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTCP1P56278 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTCP1P56278 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTCP1P56278 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTCP1P56278 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTCP1P56278 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTCP1P56278 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MTCP1P56278 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MTCP1P56278 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTCP1P56278 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTCP1P56278 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTCP1P56278 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms