Protein–RNA interactions for Protein: P42785

PRCP, Lysosomal Pro-X carboxypeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCPP42785 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRCPP42785 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRCPP42785 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRCPP42785 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PRCPP42785 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PRCPP42785 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRCPP42785 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRCPP42785 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRCPP42785 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRCPP42785 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRCPP42785 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRCPP42785 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRCPP42785 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRCPP42785 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRCPP42785 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRCPP42785 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRCPP42785 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRCPP42785 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRCPP42785 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRCPP42785 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRCPP42785 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRCPP42785 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRCPP42785 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRCPP42785 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRCPP42785 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRCPP42785 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRCPP42785 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRCPP42785 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRCPP42785 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRCPP42785 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRCPP42785 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRCPP42785 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRCPP42785 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRCPP42785 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRCPP42785 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRCPP42785 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRCPP42785 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRCPP42785 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PRCPP42785 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRCPP42785 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRCPP42785 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRCPP42785 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRCPP42785 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRCPP42785 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRCPP42785 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRCPP42785 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRCPP42785 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRCPP42785 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRCPP42785 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRCPP42785 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRCPP42785 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRCPP42785 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRCPP42785 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRCPP42785 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRCPP42785 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRCPP42785 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRCPP42785 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRCPP42785 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRCPP42785 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PRCPP42785 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRCPP42785 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRCPP42785 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PRCPP42785 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRCPP42785 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PRCPP42785 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRCPP42785 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRCPP42785 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRCPP42785 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRCPP42785 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRCPP42785 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRCPP42785 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRCPP42785 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRCPP42785 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRCPP42785 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRCPP42785 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRCPP42785 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRCPP42785 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRCPP42785 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRCPP42785 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRCPP42785 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRCPP42785 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRCPP42785 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRCPP42785 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRCPP42785 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRCPP42785 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRCPP42785 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRCPP42785 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRCPP42785 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRCPP42785 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRCPP42785 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRCPP42785 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PRCPP42785 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRCPP42785 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRCPP42785 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRCPP42785 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRCPP42785 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRCPP42785 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRCPP42785 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRCPP42785 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRCPP42785 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms