Protein–RNA interactions for Protein: P32881

IFNA8, Interferon alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA8P32881 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNA8P32881 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNA8P32881 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNA8P32881 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNA8P32881 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNA8P32881 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNA8P32881 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNA8P32881 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNA8P32881 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNA8P32881 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNA8P32881 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNA8P32881 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNA8P32881 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNA8P32881 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNA8P32881 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNA8P32881 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNA8P32881 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNA8P32881 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFNA8P32881 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFNA8P32881 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
IFNA8P32881 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFNA8P32881 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFNA8P32881 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFNA8P32881 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNA8P32881 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNA8P32881 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNA8P32881 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNA8P32881 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNA8P32881 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNA8P32881 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNA8P32881 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNA8P32881 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNA8P32881 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNA8P32881 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNA8P32881 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNA8P32881 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNA8P32881 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNA8P32881 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNA8P32881 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNA8P32881 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFNA8P32881 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFNA8P32881 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFNA8P32881 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFNA8P32881 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
IFNA8P32881 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNA8P32881 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNA8P32881 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNA8P32881 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNA8P32881 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFNA8P32881 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFNA8P32881 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFNA8P32881 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFNA8P32881 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFNA8P32881 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFNA8P32881 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFNA8P32881 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFNA8P32881 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFNA8P32881 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNA8P32881 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNA8P32881 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNA8P32881 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNA8P32881 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNA8P32881 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFNA8P32881 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFNA8P32881 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFNA8P32881 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
IFNA8P32881 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFNA8P32881 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNA8P32881 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNA8P32881 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNA8P32881 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNA8P32881 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNA8P32881 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNA8P32881 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNA8P32881 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNA8P32881 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNA8P32881 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNA8P32881 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNA8P32881 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNA8P32881 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNA8P32881 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNA8P32881 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNA8P32881 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNA8P32881 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNA8P32881 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNA8P32881 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNA8P32881 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNA8P32881 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNA8P32881 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNA8P32881 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFNA8P32881 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFNA8P32881 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFNA8P32881 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNA8P32881 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNA8P32881 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNA8P32881 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNA8P32881 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNA8P32881 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNA8P32881 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNA8P32881 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms