Protein–RNA interactions for Protein: P31930

UQCRC1, Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCRC1P31930 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UQCRC1P31930 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UQCRC1P31930 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UQCRC1P31930 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UQCRC1P31930 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UQCRC1P31930 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UQCRC1P31930 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UQCRC1P31930 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UQCRC1P31930 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UQCRC1P31930 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UQCRC1P31930 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UQCRC1P31930 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UQCRC1P31930 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UQCRC1P31930 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UQCRC1P31930 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UQCRC1P31930 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UQCRC1P31930 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UQCRC1P31930 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UQCRC1P31930 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UQCRC1P31930 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UQCRC1P31930 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UQCRC1P31930 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UQCRC1P31930 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UQCRC1P31930 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UQCRC1P31930 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UQCRC1P31930 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UQCRC1P31930 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UQCRC1P31930 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UQCRC1P31930 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UQCRC1P31930 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UQCRC1P31930 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UQCRC1P31930 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UQCRC1P31930 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UQCRC1P31930 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UQCRC1P31930 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UQCRC1P31930 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UQCRC1P31930 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UQCRC1P31930 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UQCRC1P31930 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UQCRC1P31930 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UQCRC1P31930 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UQCRC1P31930 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UQCRC1P31930 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UQCRC1P31930 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UQCRC1P31930 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UQCRC1P31930 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UQCRC1P31930 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UQCRC1P31930 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UQCRC1P31930 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UQCRC1P31930 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UQCRC1P31930 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UQCRC1P31930 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UQCRC1P31930 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UQCRC1P31930 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UQCRC1P31930 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UQCRC1P31930 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UQCRC1P31930 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UQCRC1P31930 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UQCRC1P31930 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UQCRC1P31930 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UQCRC1P31930 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UQCRC1P31930 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UQCRC1P31930 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UQCRC1P31930 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UQCRC1P31930 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UQCRC1P31930 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UQCRC1P31930 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UQCRC1P31930 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UQCRC1P31930 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UQCRC1P31930 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UQCRC1P31930 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UQCRC1P31930 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UQCRC1P31930 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
UQCRC1P31930 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UQCRC1P31930 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UQCRC1P31930 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UQCRC1P31930 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UQCRC1P31930 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UQCRC1P31930 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UQCRC1P31930 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UQCRC1P31930 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UQCRC1P31930 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UQCRC1P31930 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UQCRC1P31930 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UQCRC1P31930 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UQCRC1P31930 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UQCRC1P31930 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UQCRC1P31930 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UQCRC1P31930 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UQCRC1P31930 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UQCRC1P31930 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UQCRC1P31930 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UQCRC1P31930 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UQCRC1P31930 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UQCRC1P31930 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UQCRC1P31930 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UQCRC1P31930 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UQCRC1P31930 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UQCRC1P31930 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
UQCRC1P31930 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms