Protein–RNA interactions for Protein: P26572

MGAT1, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 2-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT1P26572 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MGAT1P26572 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MGAT1P26572 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MGAT1P26572 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MGAT1P26572 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MGAT1P26572 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MGAT1P26572 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MGAT1P26572 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MGAT1P26572 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MGAT1P26572 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MGAT1P26572 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MGAT1P26572 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MGAT1P26572 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MGAT1P26572 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MGAT1P26572 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MGAT1P26572 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MGAT1P26572 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MGAT1P26572 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MGAT1P26572 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MGAT1P26572 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MGAT1P26572 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MGAT1P26572 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MGAT1P26572 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MGAT1P26572 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MGAT1P26572 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MGAT1P26572 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MGAT1P26572 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MGAT1P26572 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MGAT1P26572 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MGAT1P26572 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MGAT1P26572 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MGAT1P26572 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MGAT1P26572 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MGAT1P26572 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MGAT1P26572 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MGAT1P26572 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MGAT1P26572 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MGAT1P26572 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MGAT1P26572 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MGAT1P26572 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MGAT1P26572 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MGAT1P26572 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MGAT1P26572 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MGAT1P26572 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MGAT1P26572 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MGAT1P26572 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MGAT1P26572 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MGAT1P26572 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MGAT1P26572 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MGAT1P26572 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MGAT1P26572 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MGAT1P26572 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MGAT1P26572 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MGAT1P26572 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MGAT1P26572 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MGAT1P26572 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MGAT1P26572 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MGAT1P26572 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MGAT1P26572 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MGAT1P26572 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MGAT1P26572 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MGAT1P26572 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MGAT1P26572 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MGAT1P26572 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MGAT1P26572 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MGAT1P26572 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MGAT1P26572 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MGAT1P26572 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MGAT1P26572 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MGAT1P26572 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MGAT1P26572 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MGAT1P26572 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MGAT1P26572 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MGAT1P26572 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MGAT1P26572 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MGAT1P26572 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MGAT1P26572 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MGAT1P26572 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MGAT1P26572 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MGAT1P26572 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MGAT1P26572 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MGAT1P26572 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MGAT1P26572 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MGAT1P26572 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MGAT1P26572 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MGAT1P26572 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MGAT1P26572 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MGAT1P26572 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MGAT1P26572 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MGAT1P26572 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MGAT1P26572 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MGAT1P26572 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MGAT1P26572 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MGAT1P26572 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MGAT1P26572 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MGAT1P26572 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MGAT1P26572 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MGAT1P26572 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MGAT1P26572 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MGAT1P26572 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1978.9 ms