Protein–RNA interactions for Protein: P26196

DDX6, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX6P26196 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.119e-9■■■■■ 49.4
DDX6P26196 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.169e-9■■■■■ 49.4
DDX6P26196 RTEL1-211ENST00000508582 4273 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.419e-9■■■■■ 49.4
DDX6P26196 PNPLA7-203ENST00000434090 2419 ntTSL 513.56□□□□□ -0.242e-8■■■■■ 48.9
DDX6P26196 PNPLA7-202ENST00000406427 4806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.452e-8■■■■■ 48.9
DDX6P26196 PNPLA7-201ENST00000277531 4581 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.482e-8■■■■■ 48.9
DDX6P26196 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.023e-12■■■■■ 48.9
DDX6P26196 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.273e-12■■■■■ 48.9
DDX6P26196 SLC4A1-202ENST00000399246 3855 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.643e-12■■■■■ 48.9
DDX6P26196 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.073e-12■■■■■ 48.7
DDX6P26196 PUM2-203ENST00000361078 6251 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.421e-7■■■■■ 48.7
DDX6P26196 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.361e-7■■■■■ 48.7
DDX6P26196 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.461e-7■■■■■ 48.7
DDX6P26196 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.011e-7■■■■■ 48.6
DDX6P26196 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 48.6
DDX6P26196 DNAJB9-203ENST00000491582 584 ntTSL 222.2■■□□□ 1.143e-10■■■■■ 48.6
DDX6P26196 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.083e-10■■■■■ 48.6
DDX6P26196 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.312e-7■■■■■ 48.3
DDX6P26196 KLHDC4-218ENST00000567298 4572 ntTSL 514.15□□□□□ -0.148e-7■■■■■ 48.1
DDX6P26196 NADSYN1-214ENST00000529120 574 ntTSL 516.93■□□□□ 0.31e-8■■■■■ 48
DDX6P26196 NADSYN1-203ENST00000524949 839 ntTSL 216.44■□□□□ 0.221e-8■■■■■ 48
DDX6P26196 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.181e-8■■■■■ 48
DDX6P26196 NADSYN1-209ENST00000527538 720 ntTSL 315.59■□□□□ 0.091e-8■■■■■ 48
DDX6P26196 NADSYN1-221ENST00000533769 559 ntTSL 415.36■□□□□ 0.051e-8■■■■■ 48
DDX6P26196 NADSYN1-213ENST00000528509 2999 ntTSL 1 (best)13.81□□□□□ -0.21e-8■■■■■ 48
DDX6P26196 NADSYN1-205ENST00000525245 603 ntTSL 59.83□□□□□ -0.841e-8■■■■■ 48
DDX6P26196 NADSYN1-204ENST00000525200 3616 ntTSL 29.23□□□□□ -0.931e-8■■■■■ 48
DDX6P26196 IPO7-201ENST00000379719 6191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.542e-6■■■■■ 47.5
DDX6P26196 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.252e-8■■■■■ 47.5
DDX6P26196 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 47.4
DDX6P26196 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.451e-6■■■■■ 47.4
DDX6P26196 ATP11A-212ENST00000487903 8858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.721e-6■■■■■ 47.4
DDX6P26196 ATP11A-209ENST00000466946 431 ntTSL 57.63□□□□□ -1.191e-6■■■■■ 47.4
DDX6P26196 TSPEAR-AS2-203ENST00000465978 345 ntTSL 513.26□□□□□ -0.297e-12■■■■■ 47.3
DDX6P26196 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 47.2
DDX6P26196 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 47.2
DDX6P26196 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.311e-6■■■■■ 46.9
DDX6P26196 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 46.7
DDX6P26196 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 46.7
DDX6P26196 EPB41L5-201ENST00000263713 6628 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 46.7
DDX6P26196 EPB41L5-204ENST00000443902 3167 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.892e-6■■■■■ 46.7
DDX6P26196 EPB41L5-202ENST00000331393 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.12e-6■■■■■ 46.7
DDX6P26196 EPB41L5-210ENST00000495030 444 ntTSL 46.92□□□□□ -1.32e-6■■■■■ 46.7
DDX6P26196 EPB41L5-206ENST00000461128 622 ntTSL 24.73□□□□□ -1.652e-6■■■■■ 46.7
DDX6P26196 KLF13-206ENST00000558921 440 ntTSL 328.26■■■□□ 2.115e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 UBE2J2-207ENST00000435198 1056 ntTSL 328.19■■■□□ 2.13e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.045e-9■■■■■ 46.6
DDX6P26196 MAP2K7-205ENST00000468058 1589 ntTSL 227■■□□□ 1.915e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.844e-11■■■■■ 46.6
DDX6P26196 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.825e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 GTF2A1-201ENST00000298173 1677 ntTSL 225.39■■□□□ 1.665e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 INAVA-203ENST00000451872 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 324.92■■□□□ 1.585e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 REPIN1-219ENST00000522266 480 ntTSL 224.86■■□□□ 1.575e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 PHF23-208ENST00000574236 583 ntTSL 324.82■■□□□ 1.564e-11■■■■■ 46.6
DDX6P26196 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.534e-11■■■■■ 46.6
DDX6P26196 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.484e-11■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TMEM260-207ENST00000555497 2218 ntTSL 223.85■■□□□ 1.415e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.41e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.375e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.365e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TUSC2-205ENST00000462137 834 ntTSL 323.53■■□□□ 1.365e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 WDR4-206ENST00000479429 759 ntTSL 523.45■■□□□ 1.345e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 RBM38-201ENST00000342690 852 ntTSL 323.08■■□□□ 1.295e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 QTRT1-207ENST00000589488 1571 ntTSL 523.04■■□□□ 1.285e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.273e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 UBE2J2-209ENST00000461142 837 ntTSL 322.94■■□□□ 1.265e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 CD164-208ENST00000506649 778 ntTSL 322.87■■□□□ 1.255e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.252e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 FARP2-217ENST00000479427 839 ntTSL 322.82■■□□□ 1.245e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 UBE2J2-214ENST00000473215 1028 ntTSL 322.78■■□□□ 1.243e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.225e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TSPAN9-208ENST00000640568 1465 ntTSL 522.62■■□□□ 1.215e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 UBE2J2-219ENST00000503294 814 ntTSL 422.39■■□□□ 1.174e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 UBE2J2-206ENST00000422076 643 ntTSL 522.39■■□□□ 1.174e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 PHF23-210ENST00000574407 497 ntTSL 222.35■■□□□ 1.174e-11■■■■■ 46.6
DDX6P26196 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.175e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 DCTD-214ENST00000512766 683 ntTSL 522.22■■□□□ 1.155e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TCF7-206ENST00000517741 796 ntTSL 522.16■■□□□ 1.145e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 PRKCZ-201ENST00000378567 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)22.14■■□□□ 1.145e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 PRKCZ-215ENST00000479263 1747 ntTSL 222.03■■□□□ 1.125e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 WDR4-204ENST00000470658 901 ntTSL 521.99■■□□□ 1.115e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.081e-8■■■■■ 46.6
DDX6P26196 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.075e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.065e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.052e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 FARP2-216ENST00000478489 617 ntTSL 321.6■■□□□ 1.055e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.035e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.035e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.035e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ANKRD11-204ENST00000378332 1982 ntTSL 221.42■■□□□ 1.022e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.025e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ZGPAT-208ENST00000472711 787 ntTSL 321.33■■□□□ 1.015e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 SEMA7A-204ENST00000567345 674 ntTSL 421.09■□□□□ 0.975e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.965e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.965e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.955e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 WIPF2-203ENST00000494757 2113 ntTSL 1 (best)20.95■□□□□ 0.945e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 YIPF6-203ENST00000451537 1070 ntTSL 220.93■□□□□ 0.945e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ACTR10-202ENST00000545307 1602 ntTSL 520.82■□□□□ 0.925e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.915e-6■■■■■ 46.6
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