Protein–RNA interactions for Protein: P20336

RAB3A, Ras-related protein Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3AP20336 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3AP20336 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3AP20336 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3AP20336 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3AP20336 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3AP20336 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3AP20336 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3AP20336 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3AP20336 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3AP20336 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3AP20336 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3AP20336 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3AP20336 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3AP20336 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3AP20336 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3AP20336 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB3AP20336 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB3AP20336 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB3AP20336 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB3AP20336 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3AP20336 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3AP20336 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3AP20336 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3AP20336 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3AP20336 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3AP20336 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB3AP20336 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB3AP20336 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB3AP20336 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB3AP20336 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB3AP20336 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3AP20336 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3AP20336 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3AP20336 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3AP20336 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3AP20336 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3AP20336 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3AP20336 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3AP20336 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3AP20336 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3AP20336 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3AP20336 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3AP20336 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3AP20336 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3AP20336 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3AP20336 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3AP20336 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB3AP20336 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB3AP20336 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB3AP20336 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3AP20336 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3AP20336 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3AP20336 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3AP20336 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3AP20336 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3AP20336 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3AP20336 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3AP20336 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3AP20336 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3AP20336 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3AP20336 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3AP20336 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3AP20336 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3AP20336 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3AP20336 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3AP20336 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3AP20336 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3AP20336 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3AP20336 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3AP20336 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3AP20336 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3AP20336 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3AP20336 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3AP20336 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3AP20336 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3AP20336 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB3AP20336 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB3AP20336 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB3AP20336 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3AP20336 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3AP20336 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3AP20336 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3AP20336 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3AP20336 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3AP20336 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3AP20336 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3AP20336 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3AP20336 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3AP20336 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3AP20336 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3AP20336 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3AP20336 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3AP20336 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3AP20336 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3AP20336 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3AP20336 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3AP20336 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3AP20336 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3AP20336 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3AP20336 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms