Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSPAN8P19075 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSPAN8P19075 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN8P19075 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN8P19075 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN8P19075 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN8P19075 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN8P19075 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN8P19075 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN8P19075 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN8P19075 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN8P19075 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN8P19075 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN8P19075 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN8P19075 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN8P19075 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN8P19075 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN8P19075 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN8P19075 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN8P19075 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN8P19075 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN8P19075 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN8P19075 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN8P19075 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN8P19075 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TSPAN8P19075 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSPAN8P19075 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSPAN8P19075 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSPAN8P19075 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN8P19075 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN8P19075 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN8P19075 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN8P19075 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSPAN8P19075 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSPAN8P19075 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSPAN8P19075 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSPAN8P19075 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSPAN8P19075 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSPAN8P19075 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSPAN8P19075 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSPAN8P19075 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSPAN8P19075 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSPAN8P19075 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSPAN8P19075 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSPAN8P19075 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSPAN8P19075 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSPAN8P19075 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSPAN8P19075 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSPAN8P19075 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSPAN8P19075 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSPAN8P19075 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TSPAN8P19075 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TSPAN8P19075 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSPAN8P19075 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TSPAN8P19075 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSPAN8P19075 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSPAN8P19075 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSPAN8P19075 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSPAN8P19075 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSPAN8P19075 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSPAN8P19075 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSPAN8P19075 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSPAN8P19075 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN8P19075 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN8P19075 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN8P19075 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSPAN8P19075 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TSPAN8P19075 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSPAN8P19075 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSPAN8P19075 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSPAN8P19075 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSPAN8P19075 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSPAN8P19075 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSPAN8P19075 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSPAN8P19075 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TSPAN8P19075 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TSPAN8P19075 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN8P19075 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN8P19075 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN8P19075 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPAN8P19075 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN8P19075 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN8P19075 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN8P19075 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN8P19075 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN8P19075 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN8P19075 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN8P19075 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN8P19075 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN8P19075 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN8P19075 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN8P19075 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN8P19075 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN8P19075 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN8P19075 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPAN8P19075 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPAN8P19075 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPAN8P19075 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPAN8P19075 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPAN8P19075 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms