Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACADSP16219 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACADSP16219 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACADSP16219 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACADSP16219 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACADSP16219 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACADSP16219 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACADSP16219 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACADSP16219 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACADSP16219 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACADSP16219 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACADSP16219 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACADSP16219 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACADSP16219 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACADSP16219 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACADSP16219 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACADSP16219 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACADSP16219 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACADSP16219 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACADSP16219 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACADSP16219 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACADSP16219 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACADSP16219 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACADSP16219 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACADSP16219 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACADSP16219 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACADSP16219 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACADSP16219 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACADSP16219 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACADSP16219 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACADSP16219 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACADSP16219 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
ACADSP16219 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACADSP16219 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACADSP16219 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACADSP16219 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACADSP16219 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACADSP16219 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACADSP16219 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACADSP16219 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACADSP16219 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ACADSP16219 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACADSP16219 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACADSP16219 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACADSP16219 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACADSP16219 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACADSP16219 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACADSP16219 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACADSP16219 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACADSP16219 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACADSP16219 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACADSP16219 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACADSP16219 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACADSP16219 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACADSP16219 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACADSP16219 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACADSP16219 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACADSP16219 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACADSP16219 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACADSP16219 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACADSP16219 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACADSP16219 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACADSP16219 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACADSP16219 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACADSP16219 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACADSP16219 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACADSP16219 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACADSP16219 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACADSP16219 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACADSP16219 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACADSP16219 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACADSP16219 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACADSP16219 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACADSP16219 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACADSP16219 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACADSP16219 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACADSP16219 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACADSP16219 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACADSP16219 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACADSP16219 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACADSP16219 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACADSP16219 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACADSP16219 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACADSP16219 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACADSP16219 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACADSP16219 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACADSP16219 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACADSP16219 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACADSP16219 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACADSP16219 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACADSP16219 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACADSP16219 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACADSP16219 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ACADSP16219 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACADSP16219 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACADSP16219 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACADSP16219 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACADSP16219 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACADSP16219 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACADSP16219 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms