Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM228BP0C875 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FAM228BP0C875 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FAM228BP0C875 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM228BP0C875 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM228BP0C875 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM228BP0C875 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM228BP0C875 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM228BP0C875 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM228BP0C875 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM228BP0C875 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM228BP0C875 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM228BP0C875 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FAM228BP0C875 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
FAM228BP0C875 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FAM228BP0C875 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM228BP0C875 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM228BP0C875 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM228BP0C875 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM228BP0C875 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM228BP0C875 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM228BP0C875 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM228BP0C875 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM228BP0C875 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM228BP0C875 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM228BP0C875 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM228BP0C875 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM228BP0C875 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM228BP0C875 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM228BP0C875 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM228BP0C875 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM228BP0C875 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM228BP0C875 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM228BP0C875 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM228BP0C875 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM228BP0C875 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM228BP0C875 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM228BP0C875 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM228BP0C875 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM228BP0C875 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM228BP0C875 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM228BP0C875 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM228BP0C875 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM228BP0C875 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM228BP0C875 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM228BP0C875 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM228BP0C875 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM228BP0C875 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM228BP0C875 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM228BP0C875 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM228BP0C875 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM228BP0C875 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM228BP0C875 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM228BP0C875 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM228BP0C875 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
FAM228BP0C875 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM228BP0C875 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM228BP0C875 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM228BP0C875 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM228BP0C875 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM228BP0C875 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FAM228BP0C875 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM228BP0C875 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM228BP0C875 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM228BP0C875 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM228BP0C875 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM228BP0C875 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM228BP0C875 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM228BP0C875 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM228BP0C875 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM228BP0C875 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM228BP0C875 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM228BP0C875 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM228BP0C875 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM228BP0C875 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FAM228BP0C875 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM228BP0C875 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM228BP0C875 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM228BP0C875 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM228BP0C875 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM228BP0C875 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM228BP0C875 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM228BP0C875 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM228BP0C875 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM228BP0C875 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM228BP0C875 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM228BP0C875 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM228BP0C875 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM228BP0C875 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM228BP0C875 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM228BP0C875 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM228BP0C875 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM228BP0C875 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM228BP0C875 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM228BP0C875 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM228BP0C875 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM228BP0C875 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM228BP0C875 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM228BP0C875 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM228BP0C875 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms