Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC00032P0C843 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC00032P0C843 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LINC00032P0C843 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00032P0C843 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00032P0C843 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00032P0C843 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00032P0C843 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00032P0C843 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00032P0C843 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00032P0C843 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00032P0C843 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00032P0C843 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00032P0C843 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00032P0C843 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00032P0C843 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00032P0C843 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00032P0C843 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00032P0C843 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00032P0C843 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00032P0C843 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00032P0C843 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00032P0C843 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00032P0C843 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00032P0C843 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00032P0C843 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00032P0C843 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00032P0C843 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00032P0C843 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00032P0C843 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00032P0C843 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00032P0C843 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00032P0C843 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00032P0C843 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00032P0C843 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00032P0C843 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00032P0C843 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00032P0C843 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00032P0C843 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00032P0C843 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00032P0C843 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00032P0C843 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00032P0C843 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00032P0C843 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00032P0C843 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00032P0C843 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00032P0C843 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00032P0C843 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00032P0C843 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00032P0C843 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00032P0C843 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00032P0C843 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LINC00032P0C843 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC00032P0C843 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC00032P0C843 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC00032P0C843 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC00032P0C843 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC00032P0C843 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00032P0C843 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00032P0C843 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00032P0C843 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00032P0C843 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00032P0C843 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00032P0C843 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC00032P0C843 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC00032P0C843 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC00032P0C843 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC00032P0C843 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC00032P0C843 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00032P0C843 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00032P0C843 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00032P0C843 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC00032P0C843 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC00032P0C843 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC00032P0C843 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC00032P0C843 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC00032P0C843 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC00032P0C843 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LINC00032P0C843 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC00032P0C843 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC00032P0C843 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC00032P0C843 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00032P0C843 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00032P0C843 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00032P0C843 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00032P0C843 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00032P0C843 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00032P0C843 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00032P0C843 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00032P0C843 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00032P0C843 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00032P0C843 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00032P0C843 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00032P0C843 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00032P0C843 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00032P0C843 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00032P0C843 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00032P0C843 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00032P0C843 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00032P0C843 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms