Protein–RNA interactions for Protein: P08708

RPS17, 40S ribosomal protein S17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS17P08708 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS17P08708 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS17P08708 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS17P08708 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS17P08708 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS17P08708 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS17P08708 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS17P08708 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPS17P08708 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPS17P08708 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS17P08708 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS17P08708 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS17P08708 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS17P08708 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS17P08708 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS17P08708 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS17P08708 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS17P08708 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS17P08708 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPS17P08708 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPS17P08708 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPS17P08708 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS17P08708 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS17P08708 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS17P08708 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS17P08708 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS17P08708 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS17P08708 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS17P08708 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPS17P08708 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPS17P08708 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPS17P08708 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPS17P08708 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPS17P08708 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPS17P08708 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RPS17P08708 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPS17P08708 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPS17P08708 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPS17P08708 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPS17P08708 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS17P08708 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS17P08708 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS17P08708 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS17P08708 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS17P08708 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPS17P08708 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPS17P08708 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPS17P08708 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPS17P08708 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS17P08708 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS17P08708 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS17P08708 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS17P08708 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS17P08708 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS17P08708 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS17P08708 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS17P08708 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS17P08708 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS17P08708 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS17P08708 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS17P08708 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS17P08708 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS17P08708 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS17P08708 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS17P08708 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS17P08708 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RPS17P08708 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS17P08708 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS17P08708 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS17P08708 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS17P08708 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS17P08708 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS17P08708 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS17P08708 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS17P08708 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS17P08708 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS17P08708 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS17P08708 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS17P08708 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS17P08708 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS17P08708 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS17P08708 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS17P08708 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS17P08708 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS17P08708 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS17P08708 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS17P08708 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS17P08708 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS17P08708 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS17P08708 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS17P08708 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS17P08708 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS17P08708 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS17P08708 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS17P08708 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS17P08708 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS17P08708 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS17P08708 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS17P08708 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS17P08708 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms