Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA5P08648 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA5P08648 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA5P08648 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA5P08648 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA5P08648 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA5P08648 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA5P08648 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA5P08648 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA5P08648 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA5P08648 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA5P08648 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA5P08648 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA5P08648 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA5P08648 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA5P08648 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA5P08648 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA5P08648 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA5P08648 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGA5P08648 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGA5P08648 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA5P08648 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA5P08648 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA5P08648 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA5P08648 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA5P08648 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA5P08648 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA5P08648 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA5P08648 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA5P08648 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA5P08648 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA5P08648 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA5P08648 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA5P08648 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA5P08648 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA5P08648 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA5P08648 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA5P08648 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA5P08648 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA5P08648 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA5P08648 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA5P08648 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA5P08648 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA5P08648 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA5P08648 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA5P08648 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA5P08648 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA5P08648 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA5P08648 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA5P08648 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA5P08648 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA5P08648 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA5P08648 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA5P08648 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA5P08648 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA5P08648 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA5P08648 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA5P08648 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA5P08648 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA5P08648 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA5P08648 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ITGA5P08648 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA5P08648 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA5P08648 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA5P08648 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA5P08648 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA5P08648 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA5P08648 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA5P08648 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA5P08648 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA5P08648 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA5P08648 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA5P08648 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA5P08648 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA5P08648 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA5P08648 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA5P08648 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA5P08648 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA5P08648 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA5P08648 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA5P08648 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA5P08648 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA5P08648 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA5P08648 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA5P08648 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA5P08648 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA5P08648 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA5P08648 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA5P08648 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA5P08648 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA5P08648 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA5P08648 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA5P08648 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA5P08648 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA5P08648 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA5P08648 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA5P08648 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA5P08648 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA5P08648 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA5P08648 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms