Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PCNTO95613 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PCNTO95613 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PCNTO95613 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PCNTO95613 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PCNTO95613 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PCNTO95613 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PCNTO95613 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PCNTO95613 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PCNTO95613 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PCNTO95613 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PCNTO95613 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PCNTO95613 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PCNTO95613 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PCNTO95613 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PCNTO95613 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PCNTO95613 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PCNTO95613 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PCNTO95613 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PCNTO95613 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PCNTO95613 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PCNTO95613 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PCNTO95613 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PCNTO95613 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PCNTO95613 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PCNTO95613 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PCNTO95613 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PCNTO95613 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PCNTO95613 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PCNTO95613 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PCNTO95613 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PCNTO95613 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
PCNTO95613 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
PCNTO95613 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
PCNTO95613 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
PCNTO95613 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PCNTO95613 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PCNTO95613 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
PCNTO95613 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PCNTO95613 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PCNTO95613 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PCNTO95613 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PCNTO95613 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PCNTO95613 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
PCNTO95613 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PCNTO95613 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PCNTO95613 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
PCNTO95613 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PCNTO95613 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PCNTO95613 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
PCNTO95613 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PCNTO95613 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PCNTO95613 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PCNTO95613 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PCNTO95613 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PCNTO95613 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PCNTO95613 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PCNTO95613 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PCNTO95613 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PCNTO95613 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PCNTO95613 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PCNTO95613 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PCNTO95613 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PCNTO95613 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PCNTO95613 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
PCNTO95613 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PCNTO95613 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PCNTO95613 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PCNTO95613 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PCNTO95613 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PCNTO95613 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PCNTO95613 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PCNTO95613 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PCNTO95613 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PCNTO95613 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
PCNTO95613 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PCNTO95613 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PCNTO95613 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PCNTO95613 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PCNTO95613 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PCNTO95613 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PCNTO95613 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PCNTO95613 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PCNTO95613 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PCNTO95613 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PCNTO95613 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PCNTO95613 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PCNTO95613 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.41
PCNTO95613 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PCNTO95613 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PCNTO95613 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
PCNTO95613 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PCNTO95613 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PCNTO95613 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PCNTO95613 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PCNTO95613 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PCNTO95613 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PCNTO95613 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PCNTO95613 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PCNTO95613 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms