Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNAPINO95295 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNAPINO95295 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNAPINO95295 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNAPINO95295 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNAPINO95295 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNAPINO95295 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNAPINO95295 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNAPINO95295 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNAPINO95295 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNAPINO95295 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNAPINO95295 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNAPINO95295 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNAPINO95295 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNAPINO95295 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNAPINO95295 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNAPINO95295 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNAPINO95295 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNAPINO95295 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SNAPINO95295 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNAPINO95295 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNAPINO95295 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNAPINO95295 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNAPINO95295 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNAPINO95295 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNAPINO95295 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNAPINO95295 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNAPINO95295 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNAPINO95295 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNAPINO95295 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNAPINO95295 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNAPINO95295 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNAPINO95295 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNAPINO95295 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNAPINO95295 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNAPINO95295 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNAPINO95295 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNAPINO95295 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SNAPINO95295 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNAPINO95295 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNAPINO95295 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNAPINO95295 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNAPINO95295 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNAPINO95295 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNAPINO95295 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNAPINO95295 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SNAPINO95295 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNAPINO95295 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNAPINO95295 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNAPINO95295 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAPINO95295 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAPINO95295 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAPINO95295 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAPINO95295 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAPINO95295 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAPINO95295 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAPINO95295 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAPINO95295 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAPINO95295 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAPINO95295 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAPINO95295 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAPINO95295 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAPINO95295 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAPINO95295 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAPINO95295 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAPINO95295 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAPINO95295 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAPINO95295 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAPINO95295 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAPINO95295 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAPINO95295 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAPINO95295 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAPINO95295 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAPINO95295 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAPINO95295 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAPINO95295 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAPINO95295 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAPINO95295 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAPINO95295 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAPINO95295 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAPINO95295 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAPINO95295 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAPINO95295 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAPINO95295 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAPINO95295 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAPINO95295 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAPINO95295 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAPINO95295 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAPINO95295 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAPINO95295 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAPINO95295 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAPINO95295 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAPINO95295 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAPINO95295 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAPINO95295 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAPINO95295 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAPINO95295 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAPINO95295 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAPINO95295 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAPINO95295 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms