Protein–RNA interactions for Protein: O95274

LYPD3, Ly6/PLAUR domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYPD3O95274 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LYPD3O95274 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LYPD3O95274 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LYPD3O95274 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYPD3O95274 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYPD3O95274 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LYPD3O95274 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYPD3O95274 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LYPD3O95274 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LYPD3O95274 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LYPD3O95274 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LYPD3O95274 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LYPD3O95274 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LYPD3O95274 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LYPD3O95274 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LYPD3O95274 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LYPD3O95274 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYPD3O95274 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYPD3O95274 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYPD3O95274 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYPD3O95274 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYPD3O95274 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYPD3O95274 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYPD3O95274 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYPD3O95274 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYPD3O95274 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYPD3O95274 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYPD3O95274 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYPD3O95274 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYPD3O95274 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYPD3O95274 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYPD3O95274 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYPD3O95274 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYPD3O95274 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYPD3O95274 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LYPD3O95274 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LYPD3O95274 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LYPD3O95274 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LYPD3O95274 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LYPD3O95274 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LYPD3O95274 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LYPD3O95274 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LYPD3O95274 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LYPD3O95274 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYPD3O95274 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYPD3O95274 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYPD3O95274 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYPD3O95274 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYPD3O95274 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYPD3O95274 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYPD3O95274 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYPD3O95274 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYPD3O95274 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYPD3O95274 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYPD3O95274 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYPD3O95274 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYPD3O95274 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYPD3O95274 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYPD3O95274 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYPD3O95274 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYPD3O95274 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYPD3O95274 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYPD3O95274 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LYPD3O95274 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LYPD3O95274 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LYPD3O95274 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LYPD3O95274 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LYPD3O95274 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LYPD3O95274 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LYPD3O95274 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LYPD3O95274 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LYPD3O95274 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LYPD3O95274 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LYPD3O95274 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LYPD3O95274 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LYPD3O95274 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LYPD3O95274 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LYPD3O95274 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LYPD3O95274 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LYPD3O95274 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LYPD3O95274 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LYPD3O95274 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LYPD3O95274 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LYPD3O95274 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LYPD3O95274 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LYPD3O95274 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LYPD3O95274 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LYPD3O95274 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LYPD3O95274 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LYPD3O95274 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LYPD3O95274 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LYPD3O95274 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LYPD3O95274 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LYPD3O95274 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LYPD3O95274 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LYPD3O95274 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LYPD3O95274 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LYPD3O95274 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LYPD3O95274 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LYPD3O95274 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms