Protein–RNA interactions for Protein: O75503

CLN5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5O75503 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN5O75503 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN5O75503 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN5O75503 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN5O75503 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN5O75503 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN5O75503 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN5O75503 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN5O75503 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN5O75503 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN5O75503 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN5O75503 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN5O75503 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN5O75503 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN5O75503 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN5O75503 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN5O75503 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLN5O75503 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLN5O75503 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLN5O75503 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLN5O75503 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLN5O75503 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLN5O75503 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLN5O75503 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLN5O75503 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLN5O75503 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CLN5O75503 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CLN5O75503 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLN5O75503 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CLN5O75503 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLN5O75503 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLN5O75503 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLN5O75503 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLN5O75503 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLN5O75503 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN5O75503 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN5O75503 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLN5O75503 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLN5O75503 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLN5O75503 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLN5O75503 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLN5O75503 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLN5O75503 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLN5O75503 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLN5O75503 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLN5O75503 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLN5O75503 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLN5O75503 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLN5O75503 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLN5O75503 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLN5O75503 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLN5O75503 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CLN5O75503 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLN5O75503 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLN5O75503 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLN5O75503 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLN5O75503 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLN5O75503 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLN5O75503 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLN5O75503 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLN5O75503 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CLN5O75503 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLN5O75503 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLN5O75503 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLN5O75503 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLN5O75503 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLN5O75503 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLN5O75503 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLN5O75503 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLN5O75503 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLN5O75503 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLN5O75503 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLN5O75503 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLN5O75503 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN5O75503 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN5O75503 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN5O75503 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN5O75503 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLN5O75503 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLN5O75503 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLN5O75503 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLN5O75503 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLN5O75503 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLN5O75503 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CLN5O75503 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLN5O75503 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLN5O75503 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLN5O75503 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLN5O75503 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLN5O75503 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLN5O75503 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLN5O75503 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CLN5O75503 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLN5O75503 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLN5O75503 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLN5O75503 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLN5O75503 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLN5O75503 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLN5O75503 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLN5O75503 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.2 ms