Protein–RNA interactions for Protein: O75494

SRSF10, Serine/arginine-rich splicing factor 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF10O75494 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SRSF10O75494 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRSF10O75494 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRSF10O75494 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SRSF10O75494 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SRSF10O75494 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRSF10O75494 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SRSF10O75494 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRSF10O75494 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF10O75494 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF10O75494 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF10O75494 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF10O75494 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF10O75494 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF10O75494 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRSF10O75494 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRSF10O75494 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRSF10O75494 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRSF10O75494 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRSF10O75494 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRSF10O75494 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRSF10O75494 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRSF10O75494 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRSF10O75494 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRSF10O75494 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRSF10O75494 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRSF10O75494 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRSF10O75494 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SRSF10O75494 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SRSF10O75494 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRSF10O75494 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRSF10O75494 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRSF10O75494 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRSF10O75494 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRSF10O75494 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRSF10O75494 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRSF10O75494 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRSF10O75494 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRSF10O75494 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRSF10O75494 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRSF10O75494 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRSF10O75494 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SRSF10O75494 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRSF10O75494 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRSF10O75494 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRSF10O75494 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF10O75494 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF10O75494 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF10O75494 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF10O75494 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF10O75494 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRSF10O75494 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRSF10O75494 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRSF10O75494 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRSF10O75494 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRSF10O75494 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRSF10O75494 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRSF10O75494 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRSF10O75494 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRSF10O75494 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRSF10O75494 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRSF10O75494 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SRSF10O75494 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRSF10O75494 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRSF10O75494 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRSF10O75494 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRSF10O75494 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRSF10O75494 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF10O75494 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF10O75494 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF10O75494 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF10O75494 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF10O75494 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRSF10O75494 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRSF10O75494 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRSF10O75494 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SRSF10O75494 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SRSF10O75494 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF10O75494 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF10O75494 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF10O75494 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF10O75494 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF10O75494 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF10O75494 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF10O75494 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF10O75494 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF10O75494 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRSF10O75494 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SRSF10O75494 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRSF10O75494 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRSF10O75494 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SRSF10O75494 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SRSF10O75494 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRSF10O75494 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRSF10O75494 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRSF10O75494 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRSF10O75494 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRSF10O75494 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRSF10O75494 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRSF10O75494 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms