Protein–RNA interactions for Protein: O43435

TBX1, T-box transcription factor TBX1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX1O43435 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBX1O43435 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBX1O43435 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBX1O43435 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBX1O43435 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBX1O43435 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBX1O43435 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBX1O43435 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBX1O43435 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TBX1O43435 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBX1O43435 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBX1O43435 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBX1O43435 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBX1O43435 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TBX1O43435 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBX1O43435 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBX1O43435 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBX1O43435 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBX1O43435 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBX1O43435 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBX1O43435 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBX1O43435 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBX1O43435 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBX1O43435 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBX1O43435 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBX1O43435 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBX1O43435 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBX1O43435 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBX1O43435 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBX1O43435 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBX1O43435 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBX1O43435 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TBX1O43435 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TBX1O43435 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TBX1O43435 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBX1O43435 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBX1O43435 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBX1O43435 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBX1O43435 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBX1O43435 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBX1O43435 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBX1O43435 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBX1O43435 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBX1O43435 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBX1O43435 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBX1O43435 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBX1O43435 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBX1O43435 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBX1O43435 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TBX1O43435 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBX1O43435 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBX1O43435 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBX1O43435 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBX1O43435 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBX1O43435 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBX1O43435 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBX1O43435 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBX1O43435 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBX1O43435 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBX1O43435 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TBX1O43435 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TBX1O43435 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TBX1O43435 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TBX1O43435 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TBX1O43435 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TBX1O43435 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TBX1O43435 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TBX1O43435 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TBX1O43435 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TBX1O43435 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TBX1O43435 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TBX1O43435 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TBX1O43435 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TBX1O43435 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TBX1O43435 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TBX1O43435 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TBX1O43435 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TBX1O43435 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TBX1O43435 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TBX1O43435 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TBX1O43435 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TBX1O43435 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBX1O43435 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBX1O43435 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBX1O43435 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBX1O43435 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBX1O43435 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBX1O43435 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBX1O43435 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBX1O43435 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBX1O43435 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBX1O43435 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBX1O43435 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBX1O43435 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBX1O43435 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBX1O43435 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBX1O43435 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBX1O43435 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBX1O43435 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBX1O43435 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms