Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TVP23AA6NH52 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TVP23AA6NH52 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TVP23AA6NH52 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TVP23AA6NH52 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TVP23AA6NH52 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TVP23AA6NH52 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TVP23AA6NH52 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TVP23AA6NH52 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TVP23AA6NH52 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TVP23AA6NH52 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TVP23AA6NH52 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TVP23AA6NH52 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TVP23AA6NH52 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TVP23AA6NH52 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TVP23AA6NH52 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TVP23AA6NH52 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TVP23AA6NH52 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TVP23AA6NH52 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TVP23AA6NH52 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TVP23AA6NH52 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TVP23AA6NH52 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TVP23AA6NH52 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TVP23AA6NH52 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TVP23AA6NH52 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TVP23AA6NH52 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TVP23AA6NH52 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TVP23AA6NH52 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TVP23AA6NH52 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TVP23AA6NH52 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TVP23AA6NH52 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TVP23AA6NH52 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TVP23AA6NH52 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TVP23AA6NH52 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TVP23AA6NH52 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TVP23AA6NH52 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TVP23AA6NH52 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TVP23AA6NH52 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TVP23AA6NH52 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TVP23AA6NH52 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TVP23AA6NH52 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TVP23AA6NH52 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TVP23AA6NH52 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TVP23AA6NH52 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TVP23AA6NH52 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TVP23AA6NH52 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TVP23AA6NH52 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TVP23AA6NH52 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TVP23AA6NH52 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TVP23AA6NH52 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TVP23AA6NH52 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TVP23AA6NH52 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TVP23AA6NH52 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TVP23AA6NH52 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TVP23AA6NH52 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TVP23AA6NH52 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TVP23AA6NH52 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TVP23AA6NH52 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TVP23AA6NH52 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TVP23AA6NH52 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TVP23AA6NH52 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TVP23AA6NH52 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TVP23AA6NH52 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TVP23AA6NH52 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TVP23AA6NH52 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TVP23AA6NH52 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TVP23AA6NH52 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TVP23AA6NH52 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TVP23AA6NH52 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TVP23AA6NH52 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TVP23AA6NH52 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TVP23AA6NH52 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TVP23AA6NH52 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TVP23AA6NH52 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TVP23AA6NH52 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TVP23AA6NH52 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TVP23AA6NH52 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TVP23AA6NH52 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TVP23AA6NH52 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TVP23AA6NH52 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TVP23AA6NH52 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TVP23AA6NH52 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TVP23AA6NH52 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TVP23AA6NH52 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TVP23AA6NH52 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TVP23AA6NH52 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TVP23AA6NH52 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TVP23AA6NH52 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TVP23AA6NH52 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TVP23AA6NH52 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TVP23AA6NH52 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TVP23AA6NH52 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TVP23AA6NH52 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TVP23AA6NH52 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TVP23AA6NH52 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TVP23AA6NH52 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TVP23AA6NH52 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TVP23AA6NH52 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TVP23AA6NH52 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TVP23AA6NH52 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.3 ms