Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GTF2E1P29083 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms