Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC31.35■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.61
EEA1Q15075 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC31.31■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
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