Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEFLP07196 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEFLP07196 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEFLP07196 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEFLP07196 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEFLP07196 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEFLP07196 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEFLP07196 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEFLP07196 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEFLP07196 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NEFLP07196 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEFLP07196 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEFLP07196 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEFLP07196 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEFLP07196 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEFLP07196 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEFLP07196 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEFLP07196 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEFLP07196 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEFLP07196 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEFLP07196 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NEFLP07196 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEFLP07196 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEFLP07196 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEFLP07196 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEFLP07196 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEFLP07196 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFLP07196 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFLP07196 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFLP07196 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFLP07196 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFLP07196 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFLP07196 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFLP07196 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFLP07196 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFLP07196 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFLP07196 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFLP07196 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFLP07196 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFLP07196 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFLP07196 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFLP07196 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFLP07196 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFLP07196 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFLP07196 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFLP07196 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEFLP07196 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEFLP07196 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEFLP07196 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEFLP07196 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEFLP07196 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEFLP07196 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEFLP07196 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEFLP07196 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEFLP07196 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEFLP07196 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEFLP07196 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEFLP07196 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEFLP07196 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEFLP07196 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEFLP07196 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEFLP07196 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEFLP07196 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEFLP07196 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEFLP07196 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEFLP07196 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEFLP07196 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NEFLP07196 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEFLP07196 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEFLP07196 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFLP07196 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFLP07196 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFLP07196 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFLP07196 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFLP07196 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFLP07196 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFLP07196 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFLP07196 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFLP07196 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFLP07196 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFLP07196 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFLP07196 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFLP07196 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFLP07196 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFLP07196 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFLP07196 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFLP07196 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFLP07196 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFLP07196 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFLP07196 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFLP07196 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFLP07196 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFLP07196 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFLP07196 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFLP07196 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEFLP07196 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEFLP07196 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEFLP07196 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEFLP07196 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEFLP07196 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms