Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK2

SOHLH1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1Q5JUK2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOHLH1Q5JUK2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOHLH1Q5JUK2 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOHLH1Q5JUK2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOHLH1Q5JUK2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOHLH1Q5JUK2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOHLH1Q5JUK2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOHLH1Q5JUK2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOHLH1Q5JUK2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOHLH1Q5JUK2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOHLH1Q5JUK2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOHLH1Q5JUK2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOHLH1Q5JUK2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOHLH1Q5JUK2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms