Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms