Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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