Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSO14618 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSO14618 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSO14618 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSO14618 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSO14618 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSO14618 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSO14618 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSO14618 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSO14618 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSO14618 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSO14618 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSO14618 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSO14618 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSO14618 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSO14618 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSO14618 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSO14618 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSO14618 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSO14618 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSO14618 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSO14618 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSO14618 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSO14618 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSO14618 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSO14618 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSO14618 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSO14618 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSO14618 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSO14618 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSO14618 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSO14618 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSO14618 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSO14618 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSO14618 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSO14618 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSO14618 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSO14618 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSO14618 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSO14618 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSO14618 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSO14618 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSO14618 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSO14618 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSO14618 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSO14618 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSO14618 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSO14618 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSO14618 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSO14618 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSO14618 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSO14618 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSO14618 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSO14618 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSO14618 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSO14618 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSO14618 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSO14618 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSO14618 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSO14618 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSO14618 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSO14618 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSO14618 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSO14618 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSO14618 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSO14618 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSO14618 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSO14618 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSO14618 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSO14618 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSO14618 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCSO14618 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCSO14618 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCSO14618 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCSO14618 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCSO14618 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCSO14618 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCSO14618 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCSO14618 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCSO14618 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSO14618 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSO14618 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSO14618 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSO14618 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSO14618 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSO14618 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSO14618 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSO14618 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSO14618 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSO14618 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSO14618 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSO14618 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSO14618 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSO14618 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSO14618 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSO14618 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSO14618 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSO14618 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSO14618 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSO14618 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms