Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PRKCHP24723 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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