Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
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