Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NECAP2Q9NVZ3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NECAP2Q9NVZ3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NECAP2Q9NVZ3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NECAP2Q9NVZ3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NECAP2Q9NVZ3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NECAP2Q9NVZ3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NECAP2Q9NVZ3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NECAP2Q9NVZ3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NECAP2Q9NVZ3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NECAP2Q9NVZ3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NECAP2Q9NVZ3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NECAP2Q9NVZ3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NECAP2Q9NVZ3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NECAP2Q9NVZ3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NECAP2Q9NVZ3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NECAP2Q9NVZ3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NECAP2Q9NVZ3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NECAP2Q9NVZ3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NECAP2Q9NVZ3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NECAP2Q9NVZ3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NECAP2Q9NVZ3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NECAP2Q9NVZ3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NECAP2Q9NVZ3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NECAP2Q9NVZ3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NECAP2Q9NVZ3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NECAP2Q9NVZ3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NECAP2Q9NVZ3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NECAP2Q9NVZ3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NECAP2Q9NVZ3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NECAP2Q9NVZ3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NECAP2Q9NVZ3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NECAP2Q9NVZ3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms