Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms