Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
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HIF1AQ16665 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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HIF1AQ16665 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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HIF1AQ16665 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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HIF1AQ16665 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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HIF1AQ16665 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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HIF1AQ16665 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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