Protein–RNA interactions for Protein: P53618

COPB1, Coatomer subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1P53618 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COPB1P53618 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COPB1P53618 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPB1P53618 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPB1P53618 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPB1P53618 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COPB1P53618 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COPB1P53618 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPB1P53618 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COPB1P53618 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COPB1P53618 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COPB1P53618 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPB1P53618 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COPB1P53618 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPB1P53618 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COPB1P53618 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COPB1P53618 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPB1P53618 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPB1P53618 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
COPB1P53618 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPB1P53618 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COPB1P53618 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COPB1P53618 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
COPB1P53618 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COPB1P53618 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COPB1P53618 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COPB1P53618 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COPB1P53618 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPB1P53618 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPB1P53618 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPB1P53618 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPB1P53618 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPB1P53618 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPB1P53618 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPB1P53618 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
COPB1P53618 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COPB1P53618 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
COPB1P53618 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COPB1P53618 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COPB1P53618 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPB1P53618 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPB1P53618 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.28■■□□□ 1
COPB1P53618 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COPB1P53618 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
COPB1P53618 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COPB1P53618 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPB1P53618 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPB1P53618 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPB1P53618 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COPB1P53618 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COPB1P53618 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPB1P53618 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COPB1P53618 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COPB1P53618 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPB1P53618 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPB1P53618 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COPB1P53618 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COPB1P53618 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.27■■□□□ 1
COPB1P53618 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPB1P53618 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COPB1P53618 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPB1P53618 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.27■■□□□ 1
COPB1P53618 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPB1P53618 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.27■■□□□ 1
COPB1P53618 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.27■■□□□ 1
COPB1P53618 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COPB1P53618 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COPB1P53618 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COPB1P53618 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COPB1P53618 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPB1P53618 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPB1P53618 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPB1P53618 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COPB1P53618 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPB1P53618 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPB1P53618 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPB1P53618 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPB1P53618 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
COPB1P53618 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
COPB1P53618 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPB1P53618 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPB1P53618 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPB1P53618 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPB1P53618 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPB1P53618 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPB1P53618 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPB1P53618 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPB1P53618 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPB1P53618 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPB1P53618 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPB1P53618 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPB1P53618 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPB1P53618 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPB1P53618 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPB1P53618 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPB1P53618 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPB1P53618 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPB1P53618 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB1P53618 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB1P53618 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms