Protein–RNA interactions for Protein: O60216

RAD21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD21O60216 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD21O60216 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD21O60216 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD21O60216 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD21O60216 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD21O60216 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD21O60216 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD21O60216 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD21O60216 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD21O60216 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD21O60216 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD21O60216 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD21O60216 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD21O60216 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD21O60216 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD21O60216 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD21O60216 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD21O60216 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD21O60216 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD21O60216 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD21O60216 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD21O60216 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD21O60216 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD21O60216 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD21O60216 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD21O60216 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD21O60216 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD21O60216 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD21O60216 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD21O60216 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD21O60216 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD21O60216 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD21O60216 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD21O60216 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD21O60216 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD21O60216 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD21O60216 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD21O60216 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD21O60216 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD21O60216 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD21O60216 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD21O60216 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD21O60216 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD21O60216 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD21O60216 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD21O60216 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD21O60216 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD21O60216 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD21O60216 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD21O60216 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD21O60216 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD21O60216 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD21O60216 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD21O60216 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD21O60216 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD21O60216 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD21O60216 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD21O60216 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD21O60216 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD21O60216 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD21O60216 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD21O60216 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD21O60216 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD21O60216 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD21O60216 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD21O60216 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD21O60216 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD21O60216 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD21O60216 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD21O60216 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD21O60216 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD21O60216 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD21O60216 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD21O60216 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD21O60216 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD21O60216 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD21O60216 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD21O60216 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD21O60216 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD21O60216 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD21O60216 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD21O60216 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD21O60216 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD21O60216 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD21O60216 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD21O60216 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD21O60216 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD21O60216 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD21O60216 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD21O60216 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD21O60216 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD21O60216 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD21O60216 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD21O60216 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD21O60216 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD21O60216 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD21O60216 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD21O60216 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD21O60216 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD21O60216 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms