Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1DQ9Y2S0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1DQ9Y2S0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1DQ9Y2S0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1DQ9Y2S0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1DQ9Y2S0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1DQ9Y2S0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1DQ9Y2S0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1DQ9Y2S0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1DQ9Y2S0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1DQ9Y2S0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1DQ9Y2S0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1DQ9Y2S0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1DQ9Y2S0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1DQ9Y2S0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1DQ9Y2S0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1DQ9Y2S0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1DQ9Y2S0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1DQ9Y2S0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1DQ9Y2S0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1DQ9Y2S0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1DQ9Y2S0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1DQ9Y2S0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1DQ9Y2S0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1DQ9Y2S0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1DQ9Y2S0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1DQ9Y2S0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1DQ9Y2S0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1DQ9Y2S0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1DQ9Y2S0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1DQ9Y2S0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1DQ9Y2S0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1DQ9Y2S0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1DQ9Y2S0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1DQ9Y2S0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR1DQ9Y2S0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR1DQ9Y2S0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1DQ9Y2S0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1DQ9Y2S0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1DQ9Y2S0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1DQ9Y2S0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1DQ9Y2S0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1DQ9Y2S0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1DQ9Y2S0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1DQ9Y2S0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1DQ9Y2S0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1DQ9Y2S0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1DQ9Y2S0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1DQ9Y2S0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1DQ9Y2S0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1DQ9Y2S0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1DQ9Y2S0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1DQ9Y2S0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1DQ9Y2S0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1DQ9Y2S0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1DQ9Y2S0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1DQ9Y2S0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1DQ9Y2S0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1DQ9Y2S0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1DQ9Y2S0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1DQ9Y2S0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1DQ9Y2S0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1DQ9Y2S0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLR1DQ9Y2S0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLR1DQ9Y2S0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLR1DQ9Y2S0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLR1DQ9Y2S0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1DQ9Y2S0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1DQ9Y2S0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1DQ9Y2S0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1DQ9Y2S0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1DQ9Y2S0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1DQ9Y2S0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1DQ9Y2S0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1DQ9Y2S0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1DQ9Y2S0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1DQ9Y2S0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1DQ9Y2S0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1DQ9Y2S0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1DQ9Y2S0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1DQ9Y2S0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1DQ9Y2S0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1DQ9Y2S0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1DQ9Y2S0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1DQ9Y2S0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1DQ9Y2S0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1DQ9Y2S0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1DQ9Y2S0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1DQ9Y2S0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1DQ9Y2S0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1DQ9Y2S0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1DQ9Y2S0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1DQ9Y2S0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1DQ9Y2S0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1DQ9Y2S0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR1DQ9Y2S0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR1DQ9Y2S0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1DQ9Y2S0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1DQ9Y2S0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1DQ9Y2S0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms