Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NCKIPSDQ9NZQ3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NCKIPSDQ9NZQ3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NCKIPSDQ9NZQ3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NCKIPSDQ9NZQ3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCKIPSDQ9NZQ3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCKIPSDQ9NZQ3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCKIPSDQ9NZQ3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCKIPSDQ9NZQ3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCKIPSDQ9NZQ3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCKIPSDQ9NZQ3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCKIPSDQ9NZQ3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCKIPSDQ9NZQ3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCKIPSDQ9NZQ3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCKIPSDQ9NZQ3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NCKIPSDQ9NZQ3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCKIPSDQ9NZQ3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCKIPSDQ9NZQ3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCKIPSDQ9NZQ3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCKIPSDQ9NZQ3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCKIPSDQ9NZQ3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCKIPSDQ9NZQ3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCKIPSDQ9NZQ3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCKIPSDQ9NZQ3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCKIPSDQ9NZQ3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCKIPSDQ9NZQ3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NCKIPSDQ9NZQ3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NCKIPSDQ9NZQ3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCKIPSDQ9NZQ3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCKIPSDQ9NZQ3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCKIPSDQ9NZQ3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCKIPSDQ9NZQ3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCKIPSDQ9NZQ3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCKIPSDQ9NZQ3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCKIPSDQ9NZQ3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCKIPSDQ9NZQ3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NCKIPSDQ9NZQ3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCKIPSDQ9NZQ3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCKIPSDQ9NZQ3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCKIPSDQ9NZQ3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCKIPSDQ9NZQ3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCKIPSDQ9NZQ3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCKIPSDQ9NZQ3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCKIPSDQ9NZQ3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCKIPSDQ9NZQ3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NCKIPSDQ9NZQ3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCKIPSDQ9NZQ3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCKIPSDQ9NZQ3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCKIPSDQ9NZQ3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NCKIPSDQ9NZQ3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCKIPSDQ9NZQ3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCKIPSDQ9NZQ3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCKIPSDQ9NZQ3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCKIPSDQ9NZQ3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCKIPSDQ9NZQ3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCKIPSDQ9NZQ3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCKIPSDQ9NZQ3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCKIPSDQ9NZQ3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCKIPSDQ9NZQ3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCKIPSDQ9NZQ3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCKIPSDQ9NZQ3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCKIPSDQ9NZQ3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCKIPSDQ9NZQ3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCKIPSDQ9NZQ3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCKIPSDQ9NZQ3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCKIPSDQ9NZQ3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCKIPSDQ9NZQ3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCKIPSDQ9NZQ3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NCKIPSDQ9NZQ3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NCKIPSDQ9NZQ3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NCKIPSDQ9NZQ3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NCKIPSDQ9NZQ3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NCKIPSDQ9NZQ3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NCKIPSDQ9NZQ3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NCKIPSDQ9NZQ3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NCKIPSDQ9NZQ3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NCKIPSDQ9NZQ3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCKIPSDQ9NZQ3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NCKIPSDQ9NZQ3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCKIPSDQ9NZQ3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCKIPSDQ9NZQ3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCKIPSDQ9NZQ3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCKIPSDQ9NZQ3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCKIPSDQ9NZQ3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCKIPSDQ9NZQ3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCKIPSDQ9NZQ3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCKIPSDQ9NZQ3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCKIPSDQ9NZQ3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCKIPSDQ9NZQ3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCKIPSDQ9NZQ3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCKIPSDQ9NZQ3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCKIPSDQ9NZQ3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCKIPSDQ9NZQ3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NCKIPSDQ9NZQ3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCKIPSDQ9NZQ3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCKIPSDQ9NZQ3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.4 ms