Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B2

RPF2, Ribosome production factor 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF2Q9H7B2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPF2Q9H7B2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RPF2Q9H7B2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPF2Q9H7B2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPF2Q9H7B2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPF2Q9H7B2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPF2Q9H7B2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPF2Q9H7B2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPF2Q9H7B2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPF2Q9H7B2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPF2Q9H7B2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPF2Q9H7B2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPF2Q9H7B2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPF2Q9H7B2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RPF2Q9H7B2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPF2Q9H7B2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPF2Q9H7B2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPF2Q9H7B2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPF2Q9H7B2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPF2Q9H7B2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPF2Q9H7B2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPF2Q9H7B2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPF2Q9H7B2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPF2Q9H7B2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPF2Q9H7B2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPF2Q9H7B2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPF2Q9H7B2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPF2Q9H7B2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPF2Q9H7B2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPF2Q9H7B2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPF2Q9H7B2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPF2Q9H7B2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPF2Q9H7B2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPF2Q9H7B2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPF2Q9H7B2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPF2Q9H7B2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPF2Q9H7B2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPF2Q9H7B2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPF2Q9H7B2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPF2Q9H7B2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPF2Q9H7B2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPF2Q9H7B2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPF2Q9H7B2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPF2Q9H7B2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPF2Q9H7B2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RPF2Q9H7B2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPF2Q9H7B2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPF2Q9H7B2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPF2Q9H7B2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPF2Q9H7B2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPF2Q9H7B2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPF2Q9H7B2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPF2Q9H7B2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPF2Q9H7B2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPF2Q9H7B2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPF2Q9H7B2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPF2Q9H7B2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPF2Q9H7B2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPF2Q9H7B2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPF2Q9H7B2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPF2Q9H7B2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPF2Q9H7B2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPF2Q9H7B2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPF2Q9H7B2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPF2Q9H7B2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPF2Q9H7B2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPF2Q9H7B2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPF2Q9H7B2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPF2Q9H7B2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPF2Q9H7B2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPF2Q9H7B2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPF2Q9H7B2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPF2Q9H7B2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPF2Q9H7B2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPF2Q9H7B2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RPF2Q9H7B2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPF2Q9H7B2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPF2Q9H7B2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPF2Q9H7B2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPF2Q9H7B2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPF2Q9H7B2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPF2Q9H7B2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPF2Q9H7B2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPF2Q9H7B2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPF2Q9H7B2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPF2Q9H7B2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPF2Q9H7B2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPF2Q9H7B2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPF2Q9H7B2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPF2Q9H7B2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPF2Q9H7B2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPF2Q9H7B2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPF2Q9H7B2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPF2Q9H7B2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPF2Q9H7B2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPF2Q9H7B2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPF2Q9H7B2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPF2Q9H7B2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPF2Q9H7B2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPF2Q9H7B2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 198.8 ms