Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG6

SCNM1, Sodium channel modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNM1Q9BWG6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCNM1Q9BWG6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCNM1Q9BWG6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCNM1Q9BWG6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCNM1Q9BWG6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCNM1Q9BWG6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCNM1Q9BWG6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SCNM1Q9BWG6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCNM1Q9BWG6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCNM1Q9BWG6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCNM1Q9BWG6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCNM1Q9BWG6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCNM1Q9BWG6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCNM1Q9BWG6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCNM1Q9BWG6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCNM1Q9BWG6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCNM1Q9BWG6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCNM1Q9BWG6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCNM1Q9BWG6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCNM1Q9BWG6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCNM1Q9BWG6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCNM1Q9BWG6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCNM1Q9BWG6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCNM1Q9BWG6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCNM1Q9BWG6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCNM1Q9BWG6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SCNM1Q9BWG6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCNM1Q9BWG6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCNM1Q9BWG6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCNM1Q9BWG6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCNM1Q9BWG6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCNM1Q9BWG6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCNM1Q9BWG6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCNM1Q9BWG6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCNM1Q9BWG6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCNM1Q9BWG6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCNM1Q9BWG6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCNM1Q9BWG6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCNM1Q9BWG6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SCNM1Q9BWG6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCNM1Q9BWG6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SCNM1Q9BWG6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCNM1Q9BWG6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCNM1Q9BWG6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCNM1Q9BWG6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SCNM1Q9BWG6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCNM1Q9BWG6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCNM1Q9BWG6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCNM1Q9BWG6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCNM1Q9BWG6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCNM1Q9BWG6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCNM1Q9BWG6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCNM1Q9BWG6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SCNM1Q9BWG6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCNM1Q9BWG6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SCNM1Q9BWG6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCNM1Q9BWG6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCNM1Q9BWG6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SCNM1Q9BWG6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCNM1Q9BWG6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCNM1Q9BWG6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCNM1Q9BWG6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCNM1Q9BWG6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCNM1Q9BWG6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCNM1Q9BWG6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCNM1Q9BWG6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCNM1Q9BWG6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCNM1Q9BWG6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCNM1Q9BWG6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCNM1Q9BWG6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCNM1Q9BWG6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCNM1Q9BWG6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCNM1Q9BWG6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCNM1Q9BWG6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCNM1Q9BWG6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCNM1Q9BWG6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCNM1Q9BWG6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCNM1Q9BWG6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCNM1Q9BWG6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCNM1Q9BWG6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCNM1Q9BWG6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCNM1Q9BWG6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCNM1Q9BWG6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCNM1Q9BWG6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCNM1Q9BWG6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCNM1Q9BWG6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SCNM1Q9BWG6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCNM1Q9BWG6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCNM1Q9BWG6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCNM1Q9BWG6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SCNM1Q9BWG6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCNM1Q9BWG6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCNM1Q9BWG6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCNM1Q9BWG6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCNM1Q9BWG6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SCNM1Q9BWG6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCNM1Q9BWG6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SCNM1Q9BWG6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCNM1Q9BWG6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCNM1Q9BWG6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 299.6 ms