Protein–RNA interactions for Protein: Q99643

SDHC, Succinate dehydrogenase cytochrome b560 subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHCQ99643 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDHCQ99643 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDHCQ99643 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHCQ99643 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHCQ99643 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SDHCQ99643 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDHCQ99643 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDHCQ99643 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDHCQ99643 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDHCQ99643 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDHCQ99643 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SDHCQ99643 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHCQ99643 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHCQ99643 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHCQ99643 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHCQ99643 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHCQ99643 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHCQ99643 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHCQ99643 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHCQ99643 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHCQ99643 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHCQ99643 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHCQ99643 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHCQ99643 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDHCQ99643 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDHCQ99643 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDHCQ99643 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDHCQ99643 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDHCQ99643 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDHCQ99643 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDHCQ99643 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDHCQ99643 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDHCQ99643 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDHCQ99643 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDHCQ99643 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDHCQ99643 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDHCQ99643 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDHCQ99643 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDHCQ99643 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDHCQ99643 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDHCQ99643 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDHCQ99643 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDHCQ99643 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDHCQ99643 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDHCQ99643 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDHCQ99643 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDHCQ99643 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDHCQ99643 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDHCQ99643 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDHCQ99643 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDHCQ99643 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDHCQ99643 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDHCQ99643 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDHCQ99643 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDHCQ99643 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDHCQ99643 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDHCQ99643 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDHCQ99643 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDHCQ99643 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDHCQ99643 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDHCQ99643 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDHCQ99643 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDHCQ99643 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDHCQ99643 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHCQ99643 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHCQ99643 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHCQ99643 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDHCQ99643 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDHCQ99643 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDHCQ99643 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDHCQ99643 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDHCQ99643 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDHCQ99643 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHCQ99643 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHCQ99643 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHCQ99643 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHCQ99643 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHCQ99643 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDHCQ99643 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDHCQ99643 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SDHCQ99643 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDHCQ99643 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDHCQ99643 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDHCQ99643 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDHCQ99643 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDHCQ99643 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDHCQ99643 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDHCQ99643 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDHCQ99643 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDHCQ99643 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDHCQ99643 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDHCQ99643 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDHCQ99643 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDHCQ99643 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDHCQ99643 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDHCQ99643 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDHCQ99643 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDHCQ99643 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDHCQ99643 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDHCQ99643 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms