Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TMEM87AQ8NBN3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TMEM87AQ8NBN3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TMEM87AQ8NBN3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TMEM87AQ8NBN3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TMEM87AQ8NBN3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TMEM87AQ8NBN3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TMEM87AQ8NBN3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMEM87AQ8NBN3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMEM87AQ8NBN3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMEM87AQ8NBN3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMEM87AQ8NBN3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMEM87AQ8NBN3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMEM87AQ8NBN3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMEM87AQ8NBN3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMEM87AQ8NBN3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMEM87AQ8NBN3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMEM87AQ8NBN3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
TMEM87AQ8NBN3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMEM87AQ8NBN3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TMEM87AQ8NBN3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMEM87AQ8NBN3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMEM87AQ8NBN3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMEM87AQ8NBN3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMEM87AQ8NBN3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMEM87AQ8NBN3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMEM87AQ8NBN3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMEM87AQ8NBN3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMEM87AQ8NBN3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMEM87AQ8NBN3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TMEM87AQ8NBN3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TMEM87AQ8NBN3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMEM87AQ8NBN3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMEM87AQ8NBN3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMEM87AQ8NBN3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMEM87AQ8NBN3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMEM87AQ8NBN3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMEM87AQ8NBN3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMEM87AQ8NBN3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMEM87AQ8NBN3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMEM87AQ8NBN3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMEM87AQ8NBN3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMEM87AQ8NBN3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMEM87AQ8NBN3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
TMEM87AQ8NBN3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMEM87AQ8NBN3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMEM87AQ8NBN3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMEM87AQ8NBN3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMEM87AQ8NBN3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMEM87AQ8NBN3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMEM87AQ8NBN3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMEM87AQ8NBN3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMEM87AQ8NBN3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMEM87AQ8NBN3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TMEM87AQ8NBN3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMEM87AQ8NBN3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMEM87AQ8NBN3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMEM87AQ8NBN3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMEM87AQ8NBN3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMEM87AQ8NBN3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMEM87AQ8NBN3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMEM87AQ8NBN3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMEM87AQ8NBN3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TMEM87AQ8NBN3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TMEM87AQ8NBN3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TMEM87AQ8NBN3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TMEM87AQ8NBN3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMEM87AQ8NBN3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMEM87AQ8NBN3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMEM87AQ8NBN3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMEM87AQ8NBN3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMEM87AQ8NBN3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMEM87AQ8NBN3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMEM87AQ8NBN3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMEM87AQ8NBN3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMEM87AQ8NBN3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMEM87AQ8NBN3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMEM87AQ8NBN3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMEM87AQ8NBN3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMEM87AQ8NBN3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMEM87AQ8NBN3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMEM87AQ8NBN3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMEM87AQ8NBN3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMEM87AQ8NBN3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMEM87AQ8NBN3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMEM87AQ8NBN3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TMEM87AQ8NBN3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TMEM87AQ8NBN3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TMEM87AQ8NBN3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TMEM87AQ8NBN3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TMEM87AQ8NBN3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TMEM87AQ8NBN3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMEM87AQ8NBN3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TMEM87AQ8NBN3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TMEM87AQ8NBN3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TMEM87AQ8NBN3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TMEM87AQ8NBN3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TMEM87AQ8NBN3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TMEM87AQ8NBN3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TMEM87AQ8NBN3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms